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外顯子測序
1.數(shù)據(jù)產(chǎn)出的統(tǒng)計,InsertSize長度檢驗2.外顯子區(qū)域測序深度統(tǒng)計3.外顯子捕獲的均一性分析
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最后更新:2013-7-29半年訪問:3
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技術(shù)路線

1.目標物種DNA提取,檢測合格; 2.對基因組DNA進行片段化處理后進行末端修復(fù);3’末端加“A”,擴增并純化擴增產(chǎn)物; 3.將檢測合格的產(chǎn)物與探針結(jié)合,實現(xiàn)目標區(qū)域的富集; 4.富集片段兩端加上測序接頭,實現(xiàn)擴增; 5.在經(jīng)qPCR質(zhì)量檢測合格后進行Solexa高通量測序。

信息分析內(nèi)容


1.數(shù)據(jù)產(chǎn)出的統(tǒng)計,InsertSize長度檢驗


2.外顯子區(qū)域測序深度統(tǒng)計


3.外顯子捕獲的均一性分析
- SNPIndels的檢測
- SNPIndels的注釋 


送樣要求


1、 基因組DNA:濃度≥100 ng/μl,總量≥50 μgOD 260/280介于1.8~2.0之間,電泳檢測無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰、完整。樣品濃度越高越好。

2、 血液樣品:請使用專業(yè)抗凝管儲存樣品。

3、 樣品中有多糖、糖蛋白的殘留,往往對打斷DNA樣品帶來非常大的麻煩,且很難去除,因此特別要求,客戶提供的樣品一定要將多糖或糖蛋白去除干凈。

4、 樣品保存期間切忌反復(fù)凍融。

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