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基因分型(特定SNP分析,等位基因分析)
仁源生物為您提供SNP、STR分型檢測,可根據客戶檢測位點數目及樣本數目在多種分型方法中采用最經濟適用的方案,最大限度為您節省經費和縮短檢測時間,給您提供最優質服務。
服務類別:分子與細胞總訪問:3988
最后更新:2017-5-17半年訪問:4
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  • 服務介紹
  • 公司簡介

 

基因分型(Genotyping)又稱為基因型分析(Genotypic assay),是利用生物學檢測方法測定個體基因型(Genotype)的技術,使用技術包括聚合酶鏈反應(PCR)、基因測序、DNA片段分析等。基因分型目前已經成為很多工作的基礎,比如基因功能研究、致病基因鑒定、基因型鑒定等。仁源生物為您提供SNP、STR分型檢測,可根據客戶檢測位點數目及樣本數目在多種分型方法中采用最經濟適用的方案,最大限度為您節省經費和縮短檢測時間,給您提供最優質服務。 

仁源生物為您提供直接法測序、高分辨率熔解曲線(HRM)快速分型兩種SNP分型檢測服務。

a)直接法測序

  SNP(single nucleotide polymorphism),即單核苷酸多態性,是由于單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態,已廣泛應用于群體遺傳學和疾病相關基因的研究,在藥物基因組學、診斷學和生物醫學研究中發揮著重要作用。

  在SNP的檢測方法中,通過PCR擴增后直接測序是十分有效的方法,被公認為是SNP檢測的“金標準”。在測序峰圖中,純合型SNP的測序峰為單一峰型,而雜合型的為雙峰,所以非常容易區分。采用這種方法,SNP檢出率接近100%。

A/A純合SNP型

A/G雜合SNP型

G/G純合SNP型

技術特點

1、 原理簡單,容易掌握,適合短基因片段的SNP篩查

2、 檢出率較高

3、 可以發現新的SNP位點

4、 給出SNP分型的最終結果

 

技術路線

 

送樣要求

1、 提供血液、組織或DNA樣品,及準確的基因名稱(基因ID)、序列和詳細的SNP位點信息

2、 血液:樣品需用EDTA抗凝,總量大于1 ml,采集后于-20℃或-80℃保存

3、 組織:樣品可為新鮮組織(最好保存于-80℃)、石蠟包埋的組織或95%乙醇中固定的組織,總量≥10mg。樣品-70℃郵寄至本公司(干冰或液氮運送)以保證樣品質量

4、 基因組DNA:濃度≥20ng/μl,總體積≥20μl。所需樣品量根據實驗要求做相應調整

5、 PCR產物:達到實驗要求的PCR產物,濃度≥50ng/μl,總體積≥20μl

 

服務提供

1、  實驗流程

2、  電泳圖

3、  測序圖譜

4、  SNP分型統計結果

 

 

b)熒光定量高分辨率熔解曲線(HRM)法

  SNP(single nucleotide polymorphism),即單核苷酸多態性,是由于單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態,已廣泛應用于群體遺傳學和疾病相關基因的研究,在藥物基因組學、診斷學和生物醫學研究中發揮著重要作用。
  熒光定量染料法使用Roche專用的HRM試劑盒,在Rocher LC480高精度定量PCR儀上進行熒光定量PCR檢測,可對已知序列的SNP位點進行大規模的篩選,具有通量大,操作簡單,成本相對較低等特點。

 

技術特點

1、  可以對已知的SNP位點進行大規模篩選

2、  應用LC480定量PCR儀進行定量檢測

3、  操作簡便,只需一步 PCR 反應,無須進行純化和預處理,即可直接上機檢測

4、 可以發現低概率的SNP多態性
 

技術路線

送樣要求

1、  請提供血液、組織或DNA樣品,及準確的基因名稱(基因ID)、序列和詳細的SNP位點信息

2、  血液:樣品需用EDTA抗凝,總量大于1 ml,采集后于-20℃或-80℃保存

3、  組織:樣品可為新鮮組織(最好保存于-80℃)、石蠟包埋的組織或95%乙醇中固定的組織,總量≥10mg。樣品-70℃郵寄至本公司(干冰或液氮運送)以保證樣品質量

4、  基因組DNA:濃度≥20ng/μl,總體積≥20μl。所需樣品量根據實驗要求做相應調整

5、 PCR產物:達到實驗要求的PCR產物,濃度≥50ng/μl,總體積≥20μl

 

提供結果

1、  包含實驗流程的詳細報告

2、  電泳圖

3、  熒光定量HRM圖結果

4、  SNP分型統計結果

 

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