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深度解析蛋白質的表征與定量

瀏覽次數:625 發布日期:2023-11-10  來源:百泰派克生物科技

在生物醫學研究中,了解蛋白質的表達和定量是理解細胞功能和疾病機制的關鍵。近年來,質譜技術在蛋白質組學領域取得了巨大的進展。其中,SWATH-DIA(Sequential Window Acquisition of All Theoretical Fragment Ion Spectra - Data Independent Acquisition)技術成為了蛋白定量領域的一項重要突破。本文將詳細介紹SWATH-DIA技術,并探索其在全景蛋白質組學中的應用,解析其深度分析蛋白質的表征和定量能力。

【什么是SWATH-DIA技術】

SWATH-DIA技術是一種質譜方法,結合了兩個關鍵步驟:SWATH掃描和數據無序采集(Data Independent Acquisition,DIA)。在SWATH掃描中,質譜儀將全范圍的質譜圖按照一系列固定大小的窗口進行分割。隨后,在DIA模式下,儀器通過逐步掃描這些窗口內的離子片段,獲取所有理論碎片離子的質譜數據。通過這種方式,SWATH-DIA技術可以獲得全景的蛋白質組學數據,包括大量的定量信息。

圖1

圖2

【蛋白質表征的深度分析】

SWATH-DIA技術在蛋白質表征方面具有獨特的優勢。傳統的質譜方法如數據依賴采集(Data Dependent Acquisition,DDA)受到了動態范圍和定性定量的限制。相比之下,SWATH-DIA技術通過在每個窗口中獲取離子片段的全譜圖,可以捕獲更廣泛的信號,并提供更準確的質譜數據。這使得研究人員可以對復雜樣品中的蛋白質進行更全面、更深入的表征。

【蛋白定量的精確分析】

SWATH-DIA技術在蛋白定量方面也具有顯著優勢。傳統的定量方法如靶向質譜法(Targeted Proteomics)通常需要事先確定要檢測的蛋白質和肽段,而SWATH-DIA技術可以同時檢測數千個蛋白質和肽段,無需預先選擇目標。通過整合SWATH-DIA獲得的全譜圖數據和數據庫搜索算法,研究人員可以準確地定量樣品中蛋白質的表達水平,甚至發現低豐度蛋白質的變化。

【SWATH-DIA的應用前景】

隨著技術的不斷改進和發展,SWATH-DIA技術在生物醫學研究中的應用前景廣闊。在疾病早期診斷、藥物研發和個體化醫療等方面,SWATH-DIA技術有望發揮重要作用。其能夠提供高通量的蛋白質組學數據,為深入理解疾病發生機制、尋找潛在的生物標志物以及開發新的治療方法提供支持。

SWATH-DIA技術作為一種全景蛋白質組學方法,具有深度解析蛋白質的表征和定量能力。其在蛋白質組學研究中的應用前景十分廣闊,為我們深入理解細胞和疾病的復雜性提供了強大的工具。隨著技術的進一步改進和普及,我們有理由相信SWATH-DIA技術將在生物醫學領域持續發展,并為我們帶來更多的新知和突破。

發布者:北京百泰派克生物科技有限公司
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E-mail:market@biotech-pack.com

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