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mRNA-seq高通量測序(有參)

mRNA測序使用oligo d(T)富集方法結合高通量測序研究mRNA的表達和調控,是幾乎所有研究的...
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最后更新:2023-04-17
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RNA甲基化(m6A MeRIP-seq)高通量測序

m6A甲基化修飾是指腺嘌呤的6號碳原子連接的氨基基團中的一個氫被甲基基團所取代。
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環(huán)狀DNA(eccDNA)測序

染色體外環(huán)狀DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)廣泛存...
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環(huán)狀RNA(circRNA-seq)測序

circRNA是通過外顯子反式剪接(back splicing)形成的一類共價閉合環(huán)狀RNA,廣泛存...
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ChIP-seq測序

ChIP-seq使用抗體富集的方法在基因組范圍內檢測多種蛋白(例如轉錄因子CTCF)和其他染色質相關...
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長鏈非編碼RNA(LncRNA-seq)高通量測序

LncRNA是一類長度大于200 nt的非編碼RNA,通常認為它們并不編碼蛋白質,而是以RNA的形式...
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NCBI GEO數(shù)據(jù)庫芯片、測序數(shù)據(jù)挖掘

GEO數(shù)據(jù)庫(或者ENA數(shù)據(jù)庫)中包含大量芯片、測序原始數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)一般都是可以免費下載使用的,充...
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miRNA-seq測序

miRNA是一類長約22 nt的非編碼小RNA。miRNA通過堿基互補配對結合到靶mRNAs 3’U...
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TCGA數(shù)據(jù)庫挖掘

TCGA,The Cancer Genome Atlas Program,癌癥基因組圖譜計劃,該數(shù)據(jù)...
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免疫浸潤(Immune infiltration)分析

腫瘤組織中并不是100%的細胞都是腫瘤細胞,還含有基質細胞,成纖維細胞,免疫細胞等,這些細胞構成了腫...
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無參轉錄組(de novo)高通量測序

隨著高通量測序的發(fā)展,越來越多的物種被測序。無參轉錄組是指在沒有參考基因組的情況下,對真核生物的轉錄...
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Cut&Tag測序

CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation),是...
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piRNA-seq高通量測序

piRNA(PIWI-interacting RNA),是一類長約25-33 nt的非編碼小RNA,...
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ATAC-seq高通量測序

ATAC-seq,即利用轉座酶研究染色質可進入性的高通量測序技術,是染色質構象研究的主流方法。
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