轉錄組學與全基因組重測序數據分析實操班通知

瀏覽次數：9843　發布日期：2019-11-26　來源：本站　本站原創，轉載請注明出處

各科研單位：

隨著新一代高通量測序技術的快速發展，在準確度大大提高的前提下, 進一步降低測序成本。由此不斷產生出巨量的分子生物學數據，這些數據有著數量巨大、關系復雜的特點，以至于不利用計算機根本無法實現數據的存儲和分析。隨著生物信息學作為新興學科迅速蓬勃發展，正在改變人們研究生物醫學的傳統方式，高通量測序技術以及數據分析技術已成為探索生物學底層機制和研究人類復雜疾病診斷、治療及預后的重要工具，廣泛應用于生命科學各個領域，是21世紀生命科學與生物技術的重要戰略前沿和主要突破口。為進一步推動我國生物信息學特別是基因組學的發展，提高從業人員的技術水平。由中科成創（北京）生物技術有限公司具體承辦，具體事宜通知如下：

一、培訓目標及特點：

本培訓以轉錄組學與基因組學的應用與數據分析為主題，精心設計了具有前沿性、實用性和針對性強的理論課程和上機課程。培訓邀請的主講人均是有理論和實際研究經驗的人員。學員通過與專家直接交流，能夠分享到這些頂尖學術機構的研究經驗和實驗設計思路。學員通過集中專題學習后能夠擴展思路，在研究技術方面領悟更多。

二、授課專家：

主講專家來自中科院科研機構的高級專家，擁有豐富的科研工作經驗，長期從事生物信息學方面的項目研究，發表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等雜志40多篇。具有資深的技術底蘊和專業背景，目前承擔國家科技部、國家自然基金委和市科技新星項目等多項課題。

三、培訓對象：

大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫學、化學、農學、計算機科學、數學類專業的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員；科研單位從事數據分析實驗室人員、生物、生命科學、微生物研究的相關人員；生物、醫藥、化學及相關企業的領導與技術骨干。

四、時間地點：2019年12月26日—12月29日（時間安排：第1天報到，授課3天）河南鄭州

五、培訓內容：

第一天	9：00-12：00 Lunix系統講解 R語言	1．常規基礎Linux命令入門講解及實操訓練。
		2．R語言簡介及安裝，RStudio的安裝及使用說明。
		3．R語言語法介紹及常用命令。
		4．R語言畫圖實操，tSNE，小提琴圖，熱圖，網絡圖，GO、KEGG富集圖等圖形繪制(實操)。
	13：30-17：30 轉錄組學數據分析在植物、動物、農學、醫學等領域的應用理論講解	1．轉錄組技術發展前沿動態。
		2．轉錄組應用案例。
		3．轉錄組分析應用熱點。
第二天	9：00-12：00 轉錄組數據分析流程及實操	1．轉錄組數據準備和軟件介紹。
		2．轉錄組數據標準化。
		3．轉錄組數據比對。
		4．DESeq2進行表達量估計和分析（實操）。
	13：30-17：30 轉錄組數據挖掘和關聯分析上機實操	轉錄組聚類分析（實操）。
		2．通過ggsurvival構建生存曲線（實操）。
		3．通過cox分析構建預后模型（實操）。
		4．lncRNA與mRNA關聯分析。
		5．個性化分析方案。
第三天	9：00-12：00 基因組學學數據分析在植物、動物、農學、醫學等領域的應用及上機操作	基因組學生物信息學前沿技術動態
		基因組重測序及數據分析
		數據模擬（實操）
		數據過濾及質量評估（實操）
		5．SOAP/Bwa/Bowtie 等軟件的使用
	13：30-17：30 單細胞測序技術應用與案例介紹、10×單細胞轉錄組數據分析思路及流程	1. 單細胞組學技術原理和科研應用。
		2. 近年單細胞方向高分文章思路解析和案例介紹。
		3. 10×官方單細胞軟件Cell ranger講解及實操。
		4. 從基因表達矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實操。
		5. 通過Seurat軟件進行PCA及tSNE降維。