Visium空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，作為第一個(gè)商業(yè)化的空間轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)平臺(tái)，這些年來(lái)極大地促進(jìn)了空間組學(xué)的發(fā)展，也助力了很多高影響因子研究成果的發(fā)表。然而，第一代產(chǎn)品55μm尺度，OCT冷凍樣本的實(shí)驗(yàn)方案，還是影響了大量臨床石蠟樣本的檢測(cè)；第二代CytAssist平臺(tái)的升級(jí)，不光實(shí)現(xiàn)了對(duì)石蠟組織樣本的拓展，也解決了樣本用普通玻璃片貼片再進(jìn)行運(yùn)送的問(wèn)題；第三代Visium HD產(chǎn)品的升級(jí)，再次突破了檢測(cè)分辨率的局限，直接從55μm提高了到2μm分辨率。雖然從分辨率上來(lái)說(shuō)，2μm的大小遠(yuǎn)小于單個(gè)細(xì)胞的直徑，但是從分析角度來(lái)說(shuō)，由于沒(méi)有更多的方法協(xié)助，還是做不到單個(gè)細(xì)胞的分辨率。如果有人跟你說(shuō)，HD就是單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)，放心，他絕對(duì)在忽悠人。

然而，要想實(shí)現(xiàn)HD數(shù)據(jù)單細(xì)胞空間分辨率的夢(mèng)想還是要有的，這會(huì)兒還真能實(shí)現(xiàn)了。利用上機(jī)樣本的HE染色圖片，結(jié)合數(shù)據(jù)2μm尺度的分辨率，我們用新的算法軟件，實(shí)現(xiàn)了對(duì)HD數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)胞分割的想法。終于，在這個(gè)動(dòng)蕩混亂的時(shí)代，我們還是在艱苦奮斗中有了一點(diǎn)小的突破。終于，在AI智能時(shí)代來(lái)臨之際，全轉(zhuǎn)錄組單細(xì)胞分辨率的Visium空間產(chǎn)品問(wèn)世了。

讓我們一起來(lái)看一下HD數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)的單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)：

分析一