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JGG—綜述CRISPR加速小麥遺傳改良研究進展

瀏覽次數(shù):1544 發(fā)布日期:2023-10-17  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
JGG|中國農(nóng)大研究團隊綜述CRISPR加速小麥遺傳改良研究進展
 
小麥(Triticum aestivum)是全球種植和消費最廣泛的作物之一,但面臨有限的耕地面積和氣候變化,維持和增加小麥產(chǎn)量成為一個巨大的挑戰(zhàn)。通過傳統(tǒng)育種方法在小麥新種質(zhì)開發(fā)上取得了一定的進展,但存在勞動密集和耗時等問題。且近年來小麥產(chǎn)量潛力趨于平穩(wěn),因此需要新型技術(shù)手段應用于小麥育種。CRISPR/Cas基因組編輯技術(shù)因其精確高效的基因組編輯能力已應用于包括小麥在內(nèi)的多種作物中。

2023年9月21日,中國農(nóng)業(yè)大學小麥研究中心在Journal of Genetics and Genomics在線發(fā)表題為“CRISPR-mediated acceleration of wheat improvement: advances and perspectives”的綜述論文。該綜述系統(tǒng)性介紹了小麥中CRISPR基因組編輯技術(shù)的開發(fā)和優(yōu)化現(xiàn)狀,重點闡述了小麥中CRISPR基因組編輯技術(shù)的工作流程和關(guān)鍵步驟相關(guān)研究,并總結(jié)和討論了CRISPR技術(shù)在小麥遺傳育種改良上的應用進展和未來發(fā)展方向。

該綜述首先全面介紹了適用于小麥的多種基因組編輯技術(shù)工具的特點和應用優(yōu)化進展,主要包括CRISPR/Cas系統(tǒng)(Cas9,Cas12a),堿基編輯(Base editing)系統(tǒng),先導編輯系統(tǒng)(Prime editing, PE)和多重基因組編輯技術(shù)。接下來,該綜述對CRISPR編輯技術(shù)的主要工作流程作簡要介紹,包括sgRNA的設(shè)計、編輯元件導入、組織再生和無轉(zhuǎn)基因的基因編輯株系分離,并重點闡述了關(guān)鍵技術(shù)步驟的基本準則和技術(shù)進展。最后,該綜述系統(tǒng)總結(jié)了近年來CRISPR技術(shù)在提高產(chǎn)量、改善品質(zhì)、抵抗生物和非生物脅迫、抗除草劑、誘導雄性不育和單倍體系、抗穗發(fā)芽等小麥遺傳改良中的應用及進展(圖1A),并討論了小麥基因組編輯技術(shù)面臨的需求挑戰(zhàn)和發(fā)展前景,包括誘導染色體結(jié)構(gòu)變異、提高遺傳轉(zhuǎn)化效率、疊加優(yōu)質(zhì)農(nóng)藝性狀、利用野生小麥種質(zhì)資源、創(chuàng)制小麥大規(guī)模突變體庫并用于篩選優(yōu)質(zhì)等位變異等(圖1B)。

 

圖1 基于基因組編輯的小麥改良進展與展望(A)CRISPR/Cas在小麥改良中的研究進展;(B)CRISPR/Cas在小麥改良中的應用前景

最后該綜述總結(jié),與傳統(tǒng)育種方法和轉(zhuǎn)基因技術(shù)相比,CRISPR/Cas系統(tǒng)在實現(xiàn)有針對性的作物改良方面具有更高的成本效益、速度和精度。當與全基因組選擇、高通量表型、擴展組學數(shù)據(jù)和人工智能相結(jié)合時,基因組編輯有可能在農(nóng)業(yè)中得到廣泛應用。

 

—— 參考文獻 ——

Zhou X, Zhao Y, Ni Pet alCRISPR-mediated acceleration of wheat improvement: advances and perspectives[J]Journal of Genetics and Genomics, 2023.
 

北大荒墾豐種業(yè)-澤泉科技生物技術(shù)與表型服務(wù)中心是由北大荒墾豐種業(yè)股份有限公司和上海澤泉科技股份有限公司共同建設(shè)的開放式高通量植物基因型-表型-育種服務(wù)平臺。中心建立了基因克隆和載體平臺、作物轉(zhuǎn)化系統(tǒng)、基因型分析平臺、表型鑒定分析平臺、數(shù)據(jù)分析和利用平臺等現(xiàn)代化生物技術(shù)和信息支持平臺,是定位于為植物科研和作物育種提供植物基因型-表型-育種數(shù)據(jù)分析的科研服務(wù)平臺。
基因編輯服務(wù)+靶向測序服務(wù)方案
為了縮短您的育種進程,提高您的育種成功率,北大荒墾豐種業(yè)-澤泉科技生物技術(shù)與表型服務(wù)中心將為您提供水稻基因編輯服務(wù)。本方案利用基因編輯酶系統(tǒng)編輯供試材料的目的基因,在不改變其他基因的情況下迅速獲取一批目的基因缺失型突變體。解決傳統(tǒng)雜交選育中存在的周期長,基因連鎖等難題。

技術(shù)路線:

 


靶向測序服務(wù)
靶向測序技術(shù)主要分為基于多重PCR的靶向基因捕獲技術(shù)(GenoPlexs)和基于液相探針雜交的靶向基因捕獲技術(shù)(GenoBaits)兩種。可完成單樣品50-5000和3000-40000標記的基因型分析,并達到可設(shè)計區(qū)域覆蓋度高于95%,擴增子均一性高于90%的捕獲效率。

 

GenoPlex基于多重PCR的靶向基因捕獲技術(shù)方案

GenoBaits基于液相探針雜交的靶向基因捕獲技術(shù)方案

應用領(lǐng)域:
 
種質(zhì)資源分析 分子標記輔助選擇
分子標記輔助回交改良 全基因組選擇
全基因組關(guān)聯(lián)分析 遺傳圖譜構(gòu)建
QTL定位  

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