液體處理專家如何自動化、標準化捕獲測序文庫制備
目標區域捕獲測序技術，是根據已知特定基因組區域序列設計寡核苷酸探針，通過雜交將目標區域捕獲富集進行二代測序。其針對目標區域深度測序，增加了檢查靈敏度和準確性。既滿足研究需求，又降低測序成本，在科研、臨床中均備受關注。
液體處理專家貝克曼庫爾特推出Biomek 自動化捕獲測序方案，幫助您實現自動化、標準化的捕獲測序。 由自動化工作站進行基因捕獲，可以減少手工操作時間，提高工作效率，增加結果的重復性和均一性。 Biomek工作站可實現從核酸提取，文庫構建，定量混樣到捕獲的整體實驗流程。
Figure 1. 捕獲測序文庫構建自動化流程
由Biomek成功自動化的雜交捕獲試劑盒：
Agilent HaloPlex™ Target Enrichment - Ion Torrent Agilent SureSelect XT® Epicentre ScriptSeq® Complete Gold Low Input Illumina Nextera® Rapid Capture Illumina TruSeq® Exome Illumina TruSeq® Rapid Exome Illumina TruSight® Cancer Illumina TruSight® Tumor 15 Illumina TruSight® Tumor 170 IDT xGen® Exome Research Panel NEB NEBNext Direct™ Cancer HotSpot Panel Roche Nimblegen SeqCap EZ® for Illumina NGSBiomek自動化捕獲測序數據展示
Figure 2. IDT xGen® Exome Research Panel試劑盒捕獲測序文庫制備。
上圖： 片段分析，其中主峰1和2為雜交捕獲后cfDNA目標片段峰；
下圖：Qubit Fluorometric Quantification核酸定量結果。
Figure 3. IDT xGen®雜交捕獲試劑盒歷史手工數據vs.
Biomek i7自動化工作站完成數據。A. 平均中靶率，B. 重復率，C. 覆蓋度，D. GC偏移。
上圖： 片段分析，其中主峰1和2為雜交捕獲后cfDNA目標片段峰；
下圖：Qubit Fluorometric Quantification核酸定量結果。
Figure 3. IDT xGen®雜交捕獲試劑盒歷史手工數據vs.
Biomek i7自動化工作站完成數據。A. 平均中靶率，B. 重復率，C. 覆蓋度，D. GC偏移。
Biomek向導式軟件操作界面
在軟件操作界面上用戶可以選擇樣本數量，是否使用臺面整合的PCR儀，以及運行工作流程的哪個部分。此外，具備臺面自動校對功能，當操作人員完成耗材擺放后，工作站可根據攝像頭拍攝，自動判定耗材擺放是否正確，對錯誤擺放位置進行提示。避免由于人為擺放耗材錯誤，導致設備碰撞或試劑、時間損失。
Figure 4. 向導式軟件操作，IDT xGen® 雜交捕獲試劑盒方法選擇界面。
Biomek自動化捕獲測序——實踐速度與通量的飛躍
Figure 5. 完成 24/48/96個樣本的自動化IDT xGen®雜交捕獲測序文庫制備預估耗時。
- Myra液體處理系統結合ADP-Glo™技術革新激酶檢測
- 使用MANTIS，通過Smart-seq3生成高質量的單細胞RNA-seq數據
- MANTIS®液體處理器用于單細胞質譜分析的SCoPE2樣品制備
- 使用SMART-Seq®單細胞試劑盒在MANTIS®液體處理器上合成cDNA
- 通過SMARTSeq單細胞試劑盒的MANTIS進行384孔板1/4體積反應cDNA合成
- 使用桌面微流體技術實現低輸入RNA-Seq樣品制備的自動化和小型化
- 磁感應qPCR儀Mic和Myra自動化液體處理系統助力“飛行獸醫”移動診斷
- 在MANTIS上用SMART-Seqv4低輸入RNA試劑盒構建cDNA1/4反應庫進行測序
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