藥物在被正式使用前，必須進行細菌內毒素檢測，而檢測細菌內毒素的方法，又屬鱟試驗法最為適宜。美國FDA已把鱟試驗法定為檢測藥物細菌內毒素檢測的法定方法。應當知道，在應用鱟試劑對藥物進行細菌內毒素檢測時，該鱟試劑的靈敏度的值不應低于0.2EU/mL，且同時應當知道藥物中細菌內毒素的耐受度限量值。

若是檢測的藥物沒能通過鱟試驗法卻通過了家兔法，這種藥物是不能被批準使用的，但該家兔法由官方進行測試的除外。若已知該藥物對鱟試驗法有抑制或者增強反應，則應當對該藥物進行抑制或者增強試驗。

檢測抗生素的細菌內毒素含量最宜使用鱟試驗法。這是因為大多部分抗生素對鱟試劑并沒有抑制反應，可以對這些抗生素應用鱟試驗法檢測細菌內毒素。但也有部分抗生素溶液對鱟試劑有抑制反應，所以進行抑制試驗時必要的。可以用無熱原水進行稀釋，知道該抗生素溶液對鱟試劑沒有抑制反應才能進行試驗。
 

出現最典型抑制鱟試劑反應的藥物要屬青霉素這一類藥物，但是對于該藥物的抑制原理并不明確。有些人認為青霉素出現抑制作用是因為該藥物的細菌細胞壁有酶；也有人說青霉素的抑制作用和血清蛋白結合率有關，但是最終都沒有一個最確切的定論。但是必須知道的是：檢測抗生素的細菌內毒素含量，鱟試驗法比家兔法靈敏10～100倍。

使用腫瘤化學療劑中的副作用與應用內毒素的反應是很像的，所以腫瘤化學療劑可能是因為內毒素污染了才會出現副作用。所以，對藥物進行細菌內毒素檢測是很有必要的，讓藥物中的細菌內毒素含量控制在安全水平以下，來減少不良反應。部分腫瘤化學療劑存在細胞毒性，所以家兔法不適合使用，但是鱟試驗法仍然是最適宜的