報告基因（reporter gene）是一種編碼可被檢測的蛋白質或酶的基因，其表達產物非常容易被鑒定。把它的編碼序列和基因調節序列相融合，在調控序列控制下進行表達，從而利用它的表達產物來標定目的基因的表達調控。

作為報告基因必須具備的條件：

（1）全序列已測定

（2）表達產物在手提細胞中不存在，即無背景，在被轉染的細胞中無相似的內源性表達產物

（3）其表達產物能夠進行定量測定

報告基因的種類很多，根據對其表達產物的分析檢測方法的不同，可將其分為體外報告基因和體內報告基因。前者的分析需要在含有報告分子的細胞裂解液或細胞、組織培養液（分泌型報告基因）中進行報告分子的定量。較典型的有氯霉素乙酰基轉移酶基因（CAT）、人生長激素基因（hGH）及分泌型堿性磷酸酶基因（SEAP）等。后者的分析可以在活的細胞或組織中，或在已經組化固定的組織或細胞中進行。較典型的如綠色熒光蛋白基因（GFP）。而β-半乳糖苷酶基因（β-Gal）和螢火蟲熒光素酶基因既可以在體外分析也可以在體內分析。

常用的報告基因系統：

√ 半乳糖苷酶報告系統

√ 熒光素酶報告系統

√ 熒光蛋白報告系統：

綠色熒光蛋白（GFP）：

    可溶性蛋白，性質穩定；

    熒光基團相當明亮；

    熒光在活細胞中即可觀察，不需要固定和組織加工；

    GFP基團和目的基因做成融合蛋白后，可以通過轉染的方法在細胞中穩定表達；

    表達GFP融合物的細胞能夠在生活狀態進行實驗和檢測。