PCR新手指南：PCR儀的三種控溫模式
在進行PCR儀中控溫模式設定時，一般有三個選項：Block、Tube及Probe。下面就這三種模式種簡單的介紹：
PCR儀的溫度傳感器一般是在模塊下面的，也就是說儀器實際能夠控制的是模塊的溫度，Block模式指的就是儀器以控制Block的溫度為目的，也就是說你輸入95度5分鐘，則模塊的溫度達到95度后開始計時，5分鐘后完成。這是最基本的控溫模式。
但是，實際上我們輸入95度5分鐘是希望PCR管內的溫度達到95后開始計時5分鐘。PCR儀器開發人員可以先將模塊溫度控制到97度（比如而已，如果不超過95度，管內溫度可以很長時間才能達到95度或根本達不到），過幾秒鐘后，等到管內溫度達到95度，再將模塊溫度降到95度。這樣做既達到了管內溫度到95度，且速度較快。但過沖的溫度量與時間及PCR管的導熱系數、PCR反應液的體積都有關系。這就是各個PCR儀廠家的核心技術了。這種控溫方式就稱為Tube模式。
如果直接將一個溫度傳感器加入PCR管中，直接測量PCR管內的溫度不是也可以嗎？這就是Probe模式，也就是在一個不進行PCR反應的管內放入一個溫度探頭，儀器根據溫度探頭測到的溫度來控制PCR管內的溫度。但傳感器的數據檢測、分析及反饋是需要時間的，這種控制模式不一定比Tube模式好，而且如果反應體積發生變化時，就比較麻煩了。
因此，如今的PCR儀就都是Block和Tube兩種模式了。如果是正常的PCR反應，一般選Tube模式。如果是長時間保溫且對溫度過沖要求很高，則可以考慮用Block模式。