敏芯代謝組學平臺介紹
上海敏芯信息科技有限公司成立于2006年,是國內第一家專業提供系統生物學技術服務的高科技公司。敏芯代謝組學平臺于2009年開始對外服務,經過近四年的發展,現平臺已擁有三大分析測試儀器(包括:GC/MS、LC/MS及NMR),實驗室面積近400平米,服務內容包括:樣本的制備、譜圖的采集、差異代謝物質的挖掘與定性、以及多組學的整合分析等。敏芯代謝組學平臺服務的客戶已達百余家,合作發表SCI論文10余篇,并成功舉辦兩期代謝組學培訓班,共培訓學員120余名。
GC-MS分析服務
氣相色譜-質譜聯用(GC-MS)技術,采用電子轟擊(EI)方式對代謝物組進行分析。本實驗平臺適宜于分析小分子、易揮發、熱穩定、能氣化的化合物。我們能提供如下服務:
實驗內容:
通過GC-MS分析技術,分析處理組和正常組生物樣本的代謝組物,通過采集圖譜數據,利用統計分析方法尋找組間中具有差異性的代謝產物,并對其定性。
實驗階段:
☆預實驗階段:對相關的實驗條件(制備方法、儀器參數等)進行摸索,優化實驗方法;
☆正式實驗階段:對樣品進行實驗操作,得到質譜圖;
數據分析階段:
對實驗得出的原始數據進行數據分析,可以提供的分析包括:
² 數據預處理
² 差異分析
² 主成分分析(PCA)
² 偏最小二乘判別分析(PLS-DA)
² ROC診斷分析
² 預測模型構建
² 多組學整合分析等
合作發表文章實例:
v 復旦大學: Jiaoran Menga, Xiaodong Zhangb, Hao Wuc, Jing Bua, Chenyi Shia, Chunhui Denga,Yu Maob, Morphine-induced conditioned place preference in mice: Metabolomic profiling of brain tissue to find “molecular switch” of drug abuse by gas chromatography/mass spectrometry,Analytica Chimica Acta.2011.IF=4.31
v 中山醫院:Hao Wu, Ruyi Xue , Huazong Zeng, Xizhong Shen et al., Metabolomic profiling of human urine in hepatocellular carcinoma patients using gas chromatography/mass spectrometry, Analytica Chimica Acta,648 (2009) 98–104.IF=4.31
v 中山醫院:Wu H, Xue R, Tang Z, Deng C, Liu T, Zeng H, Sun Y, Shen X , Metabolomic investigation of gastric cancer tissue using gas chromatography/mass spectrometry , Anal Bioanal Chem. 2010;396(4):1385-95. IF=3.841
v 中山醫院:Wu H, Xue R, Tang Z, Deng C, Liu T, Zeng H, Sun Y, Shen X , GC/MS-based metabolomic approach to validate the role of urinary sarcosine and target biomarkers for human prostate cancer by microwave-assisted derivatization.IF=3.78
詳情請訪問公司網站:www.sensichip.com.cn
bio-equip.com
上海敏芯信息科技有限公司
上海敏芯信息科技有限公司成立于2006年10月,是國內知名的生物信息學服務提供商。隨著業務擴展,公司已經發展成為國內第一家專業提供系統生物學服務的高科技企業,提供包括基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、代謝組學相關的實驗設計、實驗檢測、數據分析、結果驗證及論文修改的全面解決方案。公司已獲得國家及上海市中小企業創新基金、上海市科技創新行動計劃、上海市大學生創業基金、上海市專利試點企業、上海市技術成果轉化認證、上海市楊浦區人才資助資金等多項國家及省部級獎勵。
具體業務包括:
-基因芯片:表達譜芯片、miRNA芯片、SNP芯片、甲基化芯片、Exon芯片、Tilling芯片、lncRNA芯片等實驗及數據分析
- 高通量測序:miRNA測序、mRNA測序、基因組重測序、甲基化測序、ChIP-Seq等實驗及數據分析
-蛋白質組學:蛋白質芯片(SELDI)、細胞因子芯片、ITRAQ、Shotgun Proteomics、DIGE-2D等
- 代謝組學:液質聯用(LC-MS)、氣質聯用(GC-MS)及核磁共振(NMR)的實驗及數據分析
- 文獻挖掘:提供基于pubmed數據庫的關鍵詞搜索服務
- 生物信息培訓:定期舉辦綜合性生物信息培訓班,并提供上門培訓服務及隨到隨學班
u 專利代理:提供生命科學領域的專利寫作、專利潤色及專利申請服務
- 實驗服務:引物設計、RT-PCR、3730測序、Western Blot、2D-MS等
目前,公司國內外客戶已超過500家,合作發表了50多篇高影響因子的SCI(影響因子累計超過100分),并參與多項國家科研項目的申請與實施。