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iTRAQ/IBT/TMT蛋白定量分析
定量蛋白質組學(Quantitative Proteomics)是對一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜混合體系內所有蛋白質進行精確鑒定和定量。
服務類別:分子與細胞總訪問:553
最后更新:2022-10-17半年訪問:7
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  • 服務介紹
  • 公司簡介
 定量蛋白質組學(Quantitative Proteomics)是對一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜混合體系內所有蛋白質進行精確鑒定和定量。可用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白,結合生物信息學揭示細胞生理病理功能,同時也可對某些關鍵蛋白進行定性和定量分析。
  iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)技術是由AB SCIEX公司研發的一種體外同重同位素標記的相對與絕對定量技術。蛋白定量iTRAQ技術利用多種同位素試劑標記蛋白多肽N末端或賴氨酸側鏈基團,經高精度質譜儀串聯分析,可同時比較多達8種樣品之間的蛋白組表達量差異,是近年來定量蛋白質組學常用的高通量篩選技術。
IBT(Isobaric Tags)蛋白定量分析,作為常規iTRAQ蛋白定量分析的升級版,是華大基因首推的蛋白定量領域新產品。它基于華大基因與合作伙伴共同開發的IBT標記技術,通過深入優化實驗步驟和信息分析流程,將原本iTRAQ技術的標記上限8個樣本/批次,增加至16個樣本/批次甚至更多,結合高分辨率質譜儀高效快速的掃描效率,全面解決多于8個比較組的蛋白樣本定量問題。IBT蛋白定量分析產品能夠提供優于常規iTRAQ技術的鑒定、定量結果,為廣大客戶提供一種性價比更高的蛋白組定量分析新選擇。
TMT(Tandem Mass Tag)串聯質譜標記技術是由Thermo公司研發的一種體外同重同位素標記的相對與絕對定量技術。蛋白定量TMT技術利用多種同位素試劑標記蛋白多肽N末端或賴氨酸側鏈基團,包括4plex、8plex、16plex等不同數量標簽的產品,經高精度質譜儀串聯分析,最新推出的TMTpro 18plex可同時比較多達18個樣品之間的蛋白組表達量差異,是近年來定量蛋白質組學常用的高通量篩選技術。

標記定量1

圖1 TMT試劑結構 

 

產品優勢

  • 通量高:可同時對2-18種以內實驗樣本進行蛋白組定量分析和比較;
  • 周期短:標記混合上樣大幅度壓縮機時,縮短項目周期;
  • 重復性高:采用多個標記樣本同時上機的方法,避免樣本分別上機檢測和傳統制膠實驗重復性差的問題;
  • 經驗豐富:10余年豐富項目經驗,40+項質控保障,200+篇質譜文章發表;
  • 云平臺交付:采用Dr. Tom云平臺進行數據交付,便于開展零生信基礎的數據挖掘,以及同轉錄組的自主關聯分析;
  • 一站式、多組學服務:提供經典的蛋白質組非靶向發現+靶向驗證一站式服務;以及蛋白質組+轉錄組、蛋白質組+代謝組、常規蛋白質組+磷酸化蛋白質組學等一系列多組學關聯分析服務。

產品應用

  •  人類疾病研究:

        疾病生物標志物篩選和驗證

        疾病發生發展過程中的蛋白表達調控機制

        藥效評估

  • 動植物基礎研究:

        重要農作物農藝性及其改良措施

        動植物生長發育機制研究

        抗逆抗病機制研究

  • 微生物領域研究:

        致病機理研究

        耐藥性研究

        宿主-微生物的相互作用機制研究

技術路線

  標記定量2

信息分析

信息分析條款

信息分析條款

標準信息分析

標準信息分析內容

1.1 數據產出統計

1.2 蛋白質鑒定結果

1.3 蛋白質定量結果

1.4 蛋白質GO分析

1.5 蛋白質KOG/COG/eggNOG分析

1.6 蛋白質Pathway代謝通路分析

1.7 差異蛋白的GO富集分析

1.8 差異蛋白的Pathway富集分析

1.9 差異蛋白KOG/COG/eggNOG富集分析

1.10 重復性分析(僅針對設計了重復的實驗)

1.11多樣品間表達模式聚類(三個或三個以上樣品可提供)

1.12 差異表達蛋白互作分析

1.13 差異表達蛋白亞細胞定位

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