全基因組甲基化Bisulfite測序是DNA甲基化研究的黃金標準。
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全基因組甲基化Bisulfite測序是DNA甲基化研究的黃金標準,它通過Bisulfite處理和全基因組DNA測序結合的方式,對整個基因組上的甲基化情況進行分析,具有單堿基的分辨率,可精確評估單個C堿基的甲基化水平,覆蓋范圍廣。它可以構建精細甲基化圖譜,建立表觀遺傳學研究數據庫,為后續大規模開展不同樣品間的甲基化差異分析提供參考圖譜。
技術流程技術優勢
技術穩定性、重復性好:從樣本檢測到文庫構建、上機測序,每一步均有嚴格的標準操作Sop和對應的質控標準,保證每一個樣本都得到真實的測序結果。
Bisulfite轉化率高:經過不斷優化建庫方案,華大的甲基化建庫BS平均轉化率高達99 %以上,作為文庫構建的質控指標進行嚴格控制。
單堿基分辨率:精確分析每一個C堿基的甲基化狀態。
準確性和可靠性高:準確區分甲基化的C和未甲基化的C。
檢測范圍廣:覆蓋全基因組范圍內的所有位點。
無偏向性:反映真實的甲基化狀態。
樣品起始量低:華大基因經過不斷的研發,樣本起始量不斷降低,起始量低至pg級。
多組關聯分析:具有豐富多組學分析經驗,專項開發,可根據項目需求進行多個組學關聯分析。
經驗豐富:執行了上千個項目,數萬個樣本,合作發表文章一百多篇。
信息分析
1) 數據基本處理與質控
2) 全基因組甲基化水平分析
3) 甲基化C堿基中CG, CHG 與CHH的分布比例
4) 甲基化CG、CHG和CHH的甲基化水平分布
5) 甲基化的CG,CHG,CHH附近堿基的序列特征分析
6) 染色體水平的甲基化C堿基密度分布
7) 基因組不同轉錄元件中的DNA平均甲基化水平
8) 全基因組差異甲基化區域DMR的檢測
9) DMR相關基因的GO和Pathway分析
10) 其他定制化信息分析(可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容。)