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DAP-Seq將蛋白質體外表達技術與高通量測序技術相結合，不需要針對每個轉錄因子制備特異性抗體，所以DAP-Seq具有快速、高通量、節約時間成本等優勢。
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DNA親和純化測序(DAP-seq)
高通量檢測轉錄因子或DNA結合蛋白在基因組上的結合位點
在功能基因組學和表觀遺傳學研究中,轉錄因子結合位點(transcription factor binding sites,TFBS)的發掘一直是研究熱點。傳統的染色質免疫共沉淀測序(ChIP-seq)方法,在抗體質量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS,然而,好抗體可遇而不可求,而且植物種類抗體本就不夠齊全,這在很大程度上限制了ChIP-seq技術更廣泛的應用。
2016年,O'Mally RC 等人在Cell上發表了使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術,快速繪制轉錄因子調控靶向DNA區域圖譜的文章。2017年,Bartlett A 等人在Nature Protocol上發表了DAP-seq的實驗方法。
DAP-seq技術的出現,使TFBS的研究不再局限于物種,不再受抗體質量的限制,為生命科學領域轉錄因子的研究提供了新的有效工具,特別是植物方面的研究。
我司可為您提供DAP-seq全流程技術服務和個性化數據分析,目前,我們已有40多個物種,200多個轉錄因子的實戰經驗。
已做物種:擬南芥、煙草、水稻、小麥、玉米、大豆、棉花(陸地棉)、苜蓿、高粱、大麥草、百脈根、黃瓜、菜心、荔枝、香蕉、葡萄、蘋果、柑橘、甜橙、桃、甜瓜、甘蔗、櫻桃、芍藥、棗、核桃、毛果楊、胡楊、油松、毛白楊、大青楊、白樺、光皮樺、歐洲云杉、柳、麻風樹、金銀花、丹參、木薯、地錢、飛蝗 等。
已做轉錄因子(部分):bHLH、BES1、GATA、ARF、ERF、bZIP、C2H2、GRAS、DREB、EIN3、WRKY、AP2、NAC、TCP、G2-like、HD-Zip、MADS、MYB、BZP、NFY、RAV、SPL、WOX、CAMTA、BZR、SBP、Co-like、Dof 等。
相關技術服務
1. 凝膠阻滯實驗(EMSA)：DAP-seq后續驗證服務。
2. DAP-seq與RNA-seq聯合分析:分析轉錄因子的靶基因在RNA-seq數據中的表達變化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq測序數據,增加轉錄組測序的分析深度。
3. DNA pull down:鑒定與DNA結合的蛋白。
4. 精美的論文圖片設計與制作,提升論文的嚴謹性和美觀度。
咨詢熱線:17312598879 (朱經理)、18621342861 (侯經理),詳情請聯系我們。
