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ZVisium空間基因表達解決方案不僅可以檢測帶有空間分辨的全轉錄組表達，同時還可以捕獲相同組織切片中的組織學信息，并且可以將基因表達譜映射回組織原始的位置。
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基因表達·空間位置可視化
細胞在組織樣本中相對的位置關系對于理解疾病病理學至關重要。Visium空間基因表達解決方案不僅可以檢測帶有空間分辨的全轉錄組表達，同時還可以捕獲相同組織切片中的組織學信息，并且可以將基因表達譜映射回組織原始的位置。
該解決方案為癌癥，免疫生理學，神經科學，發育生物學等領域的研究提供組織和基因表達復雜性的新視角。
VAisium空間基因表達解決方案主要原理
用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域（6.5x6.5mm），每個捕獲區域含有5000個被條形碼標記的點（barcoded spots），直徑為55 μm，（兩點之間中心的距離為100 μm），每個點都有一個獨特的條形碼序列。當RNA從組織切片的細胞中釋放出來后，遷移到每個點的RNA會被標記上相應的條形碼序列，然后進行文庫構建并進行測序。接下來，根據數據的條形碼信息對數據進行分配，以確定哪些數據來自哪個位置。最終實現空間基因表達的可視化。
Visium空間基因表達解決方案工作流程
Visium空間基因表達解決方案送樣要求
新鮮冷凍的組織（目前已經測試的物種包括：人，小鼠，大鼠）
Visium空間基因表達解決方案技術優勢
➤ 將空間分辨的全轉錄組分析與形態學背景相結合，補充單細胞基因表達在空間信息上的空白
➤ 通過繪制所有基因活動發生的位置，獲得疾病復雜性的完整視圖
➤ 通過無偏分析發現新的目標
Visium空間基因表達解決方案研究領域
圖 小鼠大腦空間分率的表達及聚類
A.對小鼠大腦切片進行H＆E染色，成像，然后通過10x Genomics公司 visium空間基因表達解決方案工作流程進行處理;
B.展示了含有UMI計數的數據與組織空間位置的圖像疊加;
C.總基因計數;
D.基于總差異表達基因的空間 naive聚類( spatially naive clustering)。最右邊顯示了相比于其他細胞義，在細胞族4(綠色)中高表達的基因
圖 小鼠大腦中空間分辨率的基因表達
AH＆E染色小鼠冠狀腦組織切片;基因 Selena(B)和基因Tmsb4x(C)的空間mRNA表達為大腦中已知的表達模式，主要在海馬體中表達。圖中結果顯示了這兩個基因在海馬體中有顯著表達，井且與已知的表達模式一致(注意・點大小不是按比例縮放)。
