磷通常成正磷酸鹽（磷酸氫根或磷酸二氫根）形式被植物吸收。當磷進入植物體后，大部分成為有機物，有一部分仍然保持無機鹽的形式。磷以磷酸根形式存在于糖磷酸、核酸、核苷酸、輔酶、磷脂、植酸等中。磷在ATP的反應中起關鍵作用，磷在糖類代謝、蛋白質代謝、和脂肪代謝中起著重要的作用。

施磷能夠促進各種代謝正常進行，植物生長發育良好，同時提高植物的抗寒性和抗旱性。由于磷與糖類、蛋白質和脂肪的代謝和三者相互轉變都有關系，不論栽培糧食作物、豆類作物和油類作物都需要磷肥。

缺磷時，蛋白質合成受阻，新的細胞質和細胞核形成較少，影響細胞分裂，生長緩慢，分裂也少，分枝或分蘗減少，植株矮小，葉片暗綠，可能是細胞生長慢，葉綠素含量相對提高。某些植物（如油菜）葉子有時呈紅色或紫色。因為缺磷阻礙了糖分運輸，累積了大量的糖分，有利于黃色素苷的形成。缺磷時，開花期和成熟期都延遲，產量降低，抗性減弱。

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