生命科學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)與開發(fā)

The database design and development in the field of life science

生物信息科學(xué)數(shù)據(jù)共享平臺是上海研發(fā)公共服務(wù)平臺建設(shè)專項(xiàng)資助的項(xiàng)目。共享平臺集成生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)數(shù)據(jù)，建設(shè)有效、安全、可持續(xù)發(fā)展的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)匯交、管理和共享的服務(wù)平臺。

服務(wù)類別：	芯片與生物信息學(xué)	總訪問：	592
最后更新：	2015-4-2	半年訪問：	4
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服務(wù)介紹
公司簡介

生物信息科學(xué)數(shù)據(jù)共享平臺

數(shù)據(jù)中心已經(jīng)初步建立了數(shù)據(jù)服務(wù)相關(guān)的多種系統(tǒng)：1）在線/離線提交系統(tǒng)，接受用戶通過Web或者FTP工具提交的指定格式的生物學(xué)數(shù)據(jù)；2）數(shù)據(jù)提取轉(zhuǎn)換加載系統(tǒng)，處理符合格式要求的數(shù)據(jù)，加載到關(guān)系型數(shù)據(jù)庫中；3）BioEngine生命科學(xué)數(shù)據(jù)查詢系統(tǒng)，接受Entrez查詢語法的查詢請求，以靈活的方式展現(xiàn)查詢結(jié)果，并提供實(shí)時(shí)下載服務(wù)；4）；數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)，從外部數(shù)據(jù)資源定期采集所需的數(shù)據(jù)，并保存為本地文件；5）應(yīng)用程序包裝系統(tǒng)，包裝本地應(yīng)用程序，提供web service訪問接口；6）用戶注冊和管理系統(tǒng)，滿足系統(tǒng)和用戶的權(quán)限管理需求。依托這些服務(wù)系統(tǒng)，數(shù)據(jù)中心能夠提供多種數(shù)據(jù)資源的相關(guān)服務(wù)，包括普通核酸、EST、STS、GSS、Trace和SRA等核酸數(shù)據(jù)，物種數(shù)據(jù)，引物數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)。此外，數(shù)據(jù)中心還采集了大量生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域的知名刊物網(wǎng)站上發(fā)布的文獻(xiàn)補(bǔ)充材料，在HotData數(shù)據(jù)資源中提供了這些補(bǔ)充材料的查詢和下載服務(wù)。除了生命科學(xué)數(shù)據(jù)中心網(wǎng)站的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)資源建設(shè)外，我們還建設(shè) 了以血吸蟲為代表的生命科學(xué)主題數(shù)據(jù)庫與特色數(shù)據(jù)庫。相關(guān)數(shù)據(jù)服務(wù)網(wǎng)站位于http://lifecenter.sgst.cn。

技術(shù)基礎(chǔ)

生物信息科學(xué)數(shù)據(jù)共享平臺是一個(gè)典型的JavaEE應(yīng)用系統(tǒng)，n層體系結(jié)構(gòu)。使用的主要框架和技術(shù)包括Struts、Spring和 Hibernate，此外，還通過包裝本地應(yīng)用程序提供Web Service訪問接口的方式實(shí)現(xiàn)本地應(yīng)用程序的Web調(diào)用。后臺數(shù)據(jù)庫包括Oracle 10g和mySQL等。

服務(wù)方式

數(shù)據(jù)中心在開發(fā)生物信息科學(xué)數(shù)據(jù)共享平過程中，積累了大量的生命科學(xué)數(shù)據(jù)庫開發(fā)經(jīng)驗(yàn)。目前能夠承擔(dān)的任務(wù)包括：

生命科學(xué)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)：根據(jù)用戶的愿望，設(shè)計(jì)出合理的數(shù)據(jù)庫應(yīng)用原型，提供設(shè)計(jì)說明書；

生命科學(xué)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫開發(fā)與維護(hù)：根據(jù)設(shè)計(jì)說明書，開發(fā)穩(wěn)定可靠的數(shù)據(jù)庫應(yīng)用系統(tǒng)，并能夠根據(jù)數(shù)據(jù)的特點(diǎn)制定維護(hù)計(jì)劃，提供安裝說明書和維護(hù)說明書；

數(shù)據(jù)采集服務(wù)：能夠根據(jù)用戶的需求，從外部數(shù)據(jù)資源采集數(shù)據(jù)；

數(shù)據(jù)庫應(yīng)用系統(tǒng)托管服務(wù)：按照用戶的要求和說明書，托管用戶的數(shù)據(jù)庫應(yīng)用系統(tǒng)。

無錫眾信科技有限公司(Shorigen Technology Wuxi Co,.Ltd)是在無錫市引進(jìn)領(lǐng)軍型海外留學(xué)歸國創(chuàng)業(yè)人才計(jì)劃（簡稱“530”計(jì)劃）中創(chuàng)建的。公司以上海生物信息技術(shù)研究中心為依托，以中心主持和參與的國家重大科技專項(xiàng)、973、863等項(xiàng)目的科研成果為技術(shù)支撐，著重于科研成果的轉(zhuǎn)化。

目前，公司正致力于醫(yī)療衛(wèi)生信息化技術(shù)的研究、開發(fā)和服務(wù)，已研制出擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的多套醫(yī)療信息化軟件系統(tǒng)，已在全國多個(gè)醫(yī)療、科研機(jī)構(gòu)廣泛使用。

未來，公司將繼續(xù)秉承以信息技術(shù)為引領(lǐng)，著重科研成果轉(zhuǎn)化，全方位提供面向醫(yī)療、健康和生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的專業(yè)化服務(wù)，促進(jìn)公眾健康產(chǎn)業(yè)的發(fā)展，實(shí)現(xiàn)“服務(wù)大眾健康、立足信息技術(shù)”。

資質(zhì)與榮譽(yù)

2009年10月31日榮獲中國醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會“生物醫(yī)學(xué)信息技術(shù)分會常務(wù)委員”聘書

2010年04月11日榮獲中國醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會“組織生物樣本庫分會會員”聘書

2010年3月榮獲無錫市人民政府“2009年530計(jì)劃C類項(xiàng)目”

2010年12月30日“眾信樣本庫信息管理系統(tǒng)軟件”榮獲國家版權(quán)局“計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)”

2011年01月21日“眾信樣本庫信心管理系統(tǒng)軟件”通過江蘇省軟件產(chǎn)品檢測中心“軟件產(chǎn)品登記檢測”

2011年01月07日通過“ISO9001質(zhì)量管理體系認(rèn)證”

2011年05月18日通過江蘇省經(jīng)濟(jì)和信息化委員會“軟件企業(yè)認(rèn)定”

2011年05月18日“眾信樣本庫信息管理系統(tǒng)軟件”榮獲江蘇省經(jīng)濟(jì)和信息化委員會“軟件產(chǎn)品登記證書”

2011年06月01日“肺結(jié)節(jié)圖像過濾軟件系統(tǒng)” 榮獲國家版權(quán)局“計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)”

2011年06月01日“肺癌智能輔助診斷軟件系統(tǒng)” 榮獲國家版權(quán)局“計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)”

2011年06月08日“肺癌影像學(xué)導(dǎo)航學(xué)習(xí)軟件系統(tǒng)” 榮獲國家版權(quán)局 “計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)”

2011年06月21日“眾信科研電子病例管理系統(tǒng)軟件” 榮獲國家版權(quán)局“計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)”

2011年06月23日“眾信科研電子病例管理系統(tǒng)軟件”通過江蘇省軟件產(chǎn)品檢測中心“軟件產(chǎn)品登記檢測”

2011年07月05日“眾信實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)軟件” 榮獲國家版權(quán)局“計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)”

2011年07月06日榮獲無錫市科學(xué)技術(shù)局、無錫市財(cái)政局“2011年無錫市第六批科技發(fā)展計(jì)劃（創(chuàng)新基金-創(chuàng)新項(xiàng)目）項(xiàng)目（項(xiàng)目編號CBE011107）”

售后服務(wù)

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