主要優(yōu)勢在于可針對特定區(qū)域進行測序,有效的降低了測序成本,提高了測序深度,能夠更為經濟有效精確地發(fā)現特定區(qū)域遺傳變異的信息
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外顯子組:是指全部外顯子區(qū)域的集合,該區(qū)域包含合成蛋白質所需要的重要信息,涵蓋了與個體表型相關的大部分功能性變異。外顯子組測序是指利用序列捕獲技術將全基因組外顯子區(qū)域DNA捕捉并富集后進行高通量測序的基因組分析方法。
主要優(yōu)勢在于可針對特定區(qū)域進行測序,有效的降低了測序成本,提高了測序深度,能夠更為經濟有效精確地發(fā)現特定區(qū)域遺傳變異的信息。
1.目標物種DNA提取,檢測合格;
2.對基因組DNA進行片段化處理后進行末端修復;3’末端加“A”,擴增并純化擴增產物;
3.將檢測合格的產物與探針結合,實現目標區(qū)域的富集;
4.富集片段兩端加上測序接頭,實現擴增;
5.在經qPCR質量檢測合格后進行Solexa高通量測序。
基本分析
- 數據產出的統計,InsertSize長度檢驗
- 外顯子區(qū)域測序深度統計
- 外顯子捕獲的均一性分析
- SNP及Indels的檢測
- SNP及Indels的注釋
高級分析
- 氨基酸替代的預測分析
- 群體SNP的獲取和等位基因頻率評估
- 孟德爾遺傳疾病分析
- 全基因組關聯(GWAS)分析
- 陽性信號的檢測