基于新一代高通量測序平臺對目標物種小RNA大規模測序分析,能夠快速全面地鑒定該物種在特定狀態下的小RNA和發現新的小RNA,構建樣品之間的小分子RNA差異表達譜,為小RNA種類、結構和功能研究提供有力工具
主要研究方向
- 小RNA的系統識別和鑒定
- 發現新的小RNA
- 小RNA差異表達分析
技術優勢
- 高通量,低成本。
- 高準確性:讀長覆蓋小RNA全序列,產生的定量數據與實時定量PCR結果具有高度的一致性。
- 數字化信號:能夠直接從單核苷酸水平研究小分子RNA,利于區分相同家族以及序列極為相似的不同小分子RNA。
- 通用的平臺:可進行目標物種的小RNA序列測定,不需要前體序列信息或是二級結構信息。
- 豐富的信息學分析:可獲得物種全基因組水平的miRNA圖譜,實現新miRNA分子的挖掘、靶基因的預測和鑒定、樣品間差異表達分析、miRNAs聚類和表達譜分析。
樣品要求
- 樣品濃度:總RNA樣品濃度不低于750ng/ul,總量不低于20ug,提取總RNA時請避免使用過柱法;Small RNA 樣品濃度不低于2ng/ul,且Small RNA:Total RNA≥0.3%。
- 樣品純度:總RNA樣品OD值在1.8-2.2之間,制備樣品時請不要使用LiCl沉淀。建議在條件允許情況下,提供可供兩次樣品制備的量,以保證測序的按時進行。
- 需提供每個樣品具體的濃度、體積、溶劑成分、制備時間以及物種來源,同時附上QC數據,可包括電泳膠圖、分光光度或者Nanodrop儀器檢測數據、Agilent Bioanalyzer儀器檢測數據等(我們要求至少要有其中一種的檢測結果),確保總RNA 28S:18S至少大于1.8;Agilent Bioanalyzer儀器檢測獲得的RIN≥8,基線平滑,沒有上抬。
- 總RNA樣品最好在進行Solexa樣品制備前1個星期前寄出。
樣品運輸要求
- 樣品請置于1.5 ml管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口。在運輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管(或其他固體支撐物)中,再將50 ml管放在封口袋中。
- 使用足量的干冰運輸(建議盡量選用較大塊的干冰,大塊的干冰揮發較慢),并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。
- 如果條件許可,可在郵寄的箱子上下添加部分棉花,以保證盡量隔絕熱量的傳遞。
- 不建議將RNA樣品溶于異丙醇等有機溶劑中郵寄,這樣很容易造成交叉污染。
- 為了您的實驗順利進行,請您務必填寫樣品信息單。
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百邁客生物(BioMarker)成立于2009年5月,是一家高新技術企業,公司基于功能基因組學的BT+IT(高通量基因測序技術、生物信息技術、高性能生物云計算技術)技術,拓展出了高通量測序、生物云平臺、質譜檢測、智能制造四大業務板塊;擁有以博士和碩士為主體的研發、生產團隊;公司自成立以來,注重創新發展,科研成果成果層出不窮,先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等國際著名期刊上發表高質量合作文章近千篇,累計影響因子超過4500分。擁有國家發明專利技術60余項,軟件著作權近200項。公司擁有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的測序平臺,滿足科研工作者多種科研需求,努力打造基因產業國際一流企業,“為世界創造新的可能!”