新一代高通量測序技術和高性能的生物信息分析實現了表達譜分析的數字化、高效性,能夠全面、快速地定量檢測物種特定組織或發育時期的基因表達種類和豐度信息。主要研究方向
- 檢測不同組織間基因的差異表達
- 檢測同一組織不同時期基因的差異表達
- 基因表達的聚類分析
技術優勢
- 數字化信號:直接測定每個基因的特異表達標簽序列,通過計數表達標簽序列的數目來確定該基因的表達量,大大提高了定量分析的準確度。
- 可重復性高:不同批次的表達譜度量準確,能夠更準確的進行表達差異分析。
- 高靈敏度:對于表達存在差異的基因能夠靈敏的檢測其表達差異,能夠檢測出低豐度的表達基因。
- 全基因組分析:由于該技術不用事先設計探針,而是直接測序,因此無需了解物種基因信息,可以直接對物種進行包括未知基因在內的全基因表達譜分析。
- 可同時發現新的轉錄本、基因組表達調控區域等。
樣品要求
- 樣品濃度::總RNA樣品濃度不低于400 ng/ul,總量不低于20ug
- 樣品純度:總RNA樣品OD值在1.8-2.2之間,制備樣品時請不要使用LiCl沉淀。建議在條件允許情況下,提供可供兩次樣品制備的量,以保證測序的按時進行。
- 需提供每個樣品具體的濃度、體積、溶劑成分、制備時間以及物種來源,同時附上QC數據,可包括電泳膠圖、分光光度或者Nanodrop儀器檢測數據、Agilent Bioanalyzer儀器檢測數據等(我們要求至少要有其中一種的檢測結果),確保總RNA 28S:18S至少大于1.8;Agilent Bioanalyzer儀器檢測獲得的RIN≥8,基線平滑,沒有上抬。
- 總RNA樣品最好在進行Solexa樣品制備前1個星期前寄出。
樣品運輸要求
- 樣品請置于1.5 ml管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口。在運輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管(或其他固體支撐物)中,再將50 ml管放在封口袋中。
- 使用足量的干冰運輸(建議盡量選用較大塊的干冰,大塊的干冰揮發較慢),并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。
- 如果條件許可,可在郵寄的箱子上下添加部分棉花,以保證盡量隔絕熱量的傳遞。
- 不建議將RNA樣品溶于異丙醇等有機溶劑中郵寄,這樣很容易造成交叉污染。
bio-equip.com
百邁客生物(BioMarker)成立于2009年5月,是一家高新技術企業,公司基于功能基因組學的BT+IT(高通量基因測序技術、生物信息技術、高性能生物云計算技術)技術,拓展出了高通量測序、生物云平臺、質譜檢測、智能制造四大業務板塊;擁有以博士和碩士為主體的研發、生產團隊;公司自成立以來,注重創新發展,科研成果成果層出不窮,先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等國際著名期刊上發表高質量合作文章近千篇,累計影響因子超過4500分。擁有國家發明專利技術60余項,軟件著作權近200項。公司擁有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的測序平臺,滿足科研工作者多種科研需求,努力打造基因產業國際一流企業,“為世界創造新的可能!”