轉錄組是指一個活細胞在特定狀態下所能轉錄出來的所有mRNA的總和，包括編碼RNA和非編碼RNA。基于新一代高通量測序平臺的轉錄組測序能夠全面快速地獲得特定組織某個狀態下的幾乎所有的轉錄本及基因序列，發現可變剪切、新的基因或轉錄本。
主要研究方向
- 轉錄本結構研究：UTR鑒定、Intron邊界鑒定、可變剪切研究、Start codon鑒定。
- 非編碼區域功能研究：non-coding RNA研究、microRNA前體研究等。
- 基因轉錄水平研究。
- 全新轉錄區域研究。
技術優勢
- 數字化信號：直接測定每個轉錄本片段序列，單核苷酸分辨率的精確度，同時不存在傳統微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題。
- 高靈敏度：能檢測到細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本。
- 任意物種的全基因組分析：無需預先設計特異性探針，因此無需了解物種基因信息，能夠直接對任何物種進行轉錄組分析。
- 更廣的檢測范圍：高于6 個數量級的動態檢測范圍，能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。
樣品要求
- 樣品濃度：總RNA樣品濃度不低于400 ng/ul，總量不低于20ug，并進行去蛋白及DNase處理。
- 樣品純度：總RNA樣品OD值在1.8-2.2之間，制備樣品時請不要使用LiCl沉淀。建議在條件允許情況下，提供可供兩次樣品制備的量，以保證測序的按時進行。
- 需提供每個樣品具體的濃度、體積、溶劑成分、制備時間以及物種來源，同時附上QC數據，可包括電泳膠圖、分光光度或者Nanodrop儀器檢測數據、Agilent Bioanalyzer儀器檢測數據等（我們要求至少要有其中一種的檢測結果），確保總RNA 28S：18S至少大于1.8；Agilent Bioanalyzer儀器檢測獲得的RIN≥8，基線平滑，沒有上抬。
- 總RNA樣品最好在進行Solexa樣品制備前1個星期前寄出。
樣品運輸要求
- 樣品請置于1.5 ml管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間，管口使用Parafilm封口。在運輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管（或其他固體支撐物）中，再將50 ml管放在封口袋中。
- 使用足量的干冰運輸（建議盡量選用較大塊的干冰，大塊的干冰揮發較慢），并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運輸過程中樣品降解的可能性。
- 如果條件許可，可在郵寄的箱子上下添加部分棉花，以保證盡量隔絕熱量的傳遞。
- 不建議將RNA樣品溶于異丙醇等有機溶劑中郵寄，這樣很容易造成交叉污染。
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