技術(shù)應(yīng)用范圍
應(yīng)用目標(biāo):
1.鑒定與重要農(nóng)藝性狀相關(guān)的QTL
2.尋找并克隆具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的功能基因
3.進(jìn)行分子標(biāo)記輔助育種,培育一批良種
適用于有參考基因組物種:如水稻、玉米、高粱、大豆、谷子、黃瓜、甘藍(lán)、白菜、番茄、馬鈴薯 、擬南芥等。
研究對(duì)象及條件
具有重要農(nóng)藝性狀的臨時(shí)(F2作圖群體)或永久群體(如重組自交系、雙單倍體系等)群體。
項(xiàng)目開(kāi)發(fā)方案
根據(jù)標(biāo)記密度等開(kāi)發(fā)需求的不同,設(shè)計(jì)了3種方案,詳細(xì)內(nèi)容如下表所示。根據(jù)不同的研發(fā)需求可以定制個(gè)性化方案。
項(xiàng)目資源要求 |
標(biāo)準(zhǔn)解決方案 |
推薦解決方案 |
深入解決方案 |
群 體 需 求 |
親本 |
2 |
2 |
2 |
親本多態(tài)性 |
>10% |
>10% |
>10% |
群體大小 |
50 |
100 |
200 |
適用群體類型 |
F2,永久群體(DH、RILs) |
性狀分離 |
需要 |
需要 |
需要 |
區(qū)分個(gè)體 |
是 |
是 |
是 |
測(cè) 序 標(biāo) 準(zhǔn) |
親本標(biāo)簽測(cè)序深度 |
20x |
20x |
20x |
個(gè)體標(biāo)簽平均測(cè)序深度 |
3x |
3x |
3x |
總體標(biāo)簽測(cè)序深度 |
190x |
340x |
640x |
標(biāo)簽個(gè)數(shù) |
10,000 |
20,000 |
50,000 |
基于SLAF-seq技術(shù)的遺傳圖譜繪制方案 |
項(xiàng)目開(kāi)發(fā)時(shí)間
項(xiàng)目開(kāi)發(fā)時(shí)間預(yù)計(jì)為4個(gè)月,具體方案如下表所示:
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bio-equip.com
百邁客生物(BioMarker)成立于2009年5月,是一家高新技術(shù)企業(yè),公司基于功能基因組學(xué)的BT+IT(高通量基因測(cè)序技術(shù)、生物信息技術(shù)、高性能生物云計(jì)算技術(shù))技術(shù),拓展出了高通量測(cè)序、生物云平臺(tái)、質(zhì)譜檢測(cè)、智能制造四大業(yè)務(wù)板塊;擁有以博士和碩士為主體的研發(fā)、生產(chǎn)團(tuán)隊(duì);公司自成立以來(lái),注重創(chuàng)新發(fā)展,科研成果成果層出不窮,先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等國(guó)際著名期刊上發(fā)表高質(zhì)量合作文章近千篇,累計(jì)影響因子超過(guò)4500分。擁有國(guó)家發(fā)明專利技術(shù)60余項(xiàng),軟件著作權(quán)近200項(xiàng)。公司擁有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的測(cè)序平臺(tái),滿足科研工作者多種科研需求,努力打造基因產(chǎn)業(yè)國(guó)際一流企業(yè),“為世界創(chuàng)造新的可能!”