應用目標：針對較大分離群體能更精細的將篩選到的關聯緊密的候選區域在基因組上定位，直接對該區域進行功能基因的精細注釋，獲得性狀相關候選基因。

已有或即將有全基因組參考序列的物種。如玉米、大豆、水稻、甘藍、白菜、高粱、黃瓜、西瓜、馬鈴薯、番茄、擬南芥等物種，尤其適用于抗蟲、抗病、高產等重要經濟性狀。

應用目標：針對較大分離群體進行目標性狀分子標記開發，更準確的對分子標記與性狀的關聯性強弱進行排序分析，由此獲得的強關聯性分子標記為下游的基因精細定位工作打下堅實基礎。

目前沒有基因組參考序列的物種。如小麥、棉花、油菜、辣椒、魚類、對蝦、花卉、林木、煙草、藥用植物等。

研究對象

具有一定規模的臨時（如F1、F2分離群體）或永久群體（如重組自交系、近等基因系、雙單倍體系、回交近交系等），性狀有明顯差異的父、母本材料，親本之間的多態性不低于10%；

性狀分離群體，每個群體個體要盡量多，最好不少于20個（單株），材料越多，越有利于清除背景噪音。

對于沒有參考基因組的物種，親本最好構建BAC文庫，為下游的強關聯標記的定位研究打下基礎。為了更精確的進行功能基因的注釋最好有表達譜或EST序列。

根據標記密度和標記測序深度等開發需求的不同，設計了3種方案，詳細內容如下表所示。根據不同的研發需求可以定制個性化方案。

基于SLAF-seq技術的關聯性圖譜繪制方案

整體計劃3個月完成多態性標記開發及其與目標性狀的關聯分析，具體時間規劃如下表所示。根據物種的不同開發時間會稍有不同。

基于SLAF-seq技術的關聯性圖譜繪制開發時間

技術路線 A: 親本SNP和inDel標記開發 B：super BSA快速定位流程

百邁客生物(BioMarker)成立于2009年5月，是一家高新技術企業，公司基于功能基因組學的BT+IT(高通量基因測序技術、生物信息技術、高性能生物云計算技術)技術，拓展出了高通量測序、生物云平臺、質譜檢測、智能制造四大業務板塊；擁有以博士和碩士為主體的研發、生產團隊；公司自成立以來，注重創新發展，科研成果成果層出不窮，先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等國際著名期刊上發表高質量合作文章近千篇，累計影響因子超過4500分。擁有國家發明專利技術60余項，軟件著作權近200項。公司擁有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的測序平臺，滿足科研工作者多種科研需求，努力打造基因產業國際一流企業，“為世界創造新的可能！”