應(yīng)用目標(biāo)：
１．將多態(tài)性標(biāo)記進(jìn)行遺傳連鎖距離計(jì)算，繪制高密度遺傳圖譜。同時(shí)進(jìn)行與性狀的關(guān)聯(lián)性分析，利用獲得的強(qiáng)關(guān)聯(lián)性標(biāo)記進(jìn)行下游的基因精細(xì)定位。
２．對(duì)基因組過大且結(jié)構(gòu)復(fù)雜，全基因組De novo組裝困難的物種，利用精細(xì)的遺傳圖譜將初步拼接得到的片段以染色體為單位組裝起來，獲得完整性高的全基因組精細(xì)圖譜。

目前沒有基因組參考序列的物種。如小麥、棉花、油菜、辣椒、魚類、對(duì)蝦、花卉、林木、煙草、藥用植物等。

具有重要農(nóng)藝性狀的臨時(shí)（如F1、F2作圖群體）或永久群體（如重組自交系、近等基因系、雙單倍體系、回交近交系等）群體，群體材料最好有BAC/Fosmid文庫，為后期獲得的標(biāo)記位置關(guān)系和通過標(biāo)記定位的區(qū)間內(nèi)的基因做準(zhǔn)備；

按照各個(gè)性狀分離情況，挑選重要性狀表現(xiàn)型極端差異明顯個(gè)體，每個(gè)目標(biāo)性狀極端差異個(gè)體數(shù)量在群體內(nèi)保持均衡。

項(xiàng)目開發(fā)方案 根據(jù)標(biāo)記密度和標(biāo)記測序深度等開發(fā)需求的不同，設(shè)計(jì)了3種方案，詳細(xì)內(nèi)容如下表所示。根據(jù)不同的研發(fā)需求可以定制個(gè)性化方案。 項(xiàng)目資源要求 標(biāo)準(zhǔn)解決方案 推薦解決方案 深入解決方案 群 體 需 求 親本   2 2 2 親本多態(tài)性   >10% >10% >10% 群體大小   50 100 200 適用群體類型   遺傳分離群體（臨時(shí)、永久群體均可） 性狀分離   需要 需要 需要 區(qū)分個(gè)體   是 是 是 測 序 標(biāo) 準(zhǔn) 親本標(biāo)簽測序深度   20x 20x 20x 個(gè)體標(biāo)簽平均測序深度 4x 4x 4x 總體標(biāo)簽測序深度   240x 440x 840x 標(biāo)簽個(gè)數(shù)   10,000 20,000 50,000 基于SLAF-seq技術(shù)的遺傳圖譜繪制方案

整體計(jì)劃4個(gè)月完成高密度遺傳圖譜構(gòu)建，具體時(shí)間規(guī)劃如下表所示。根據(jù)物種的不同開發(fā)時(shí)間會(huì)稍有不同。

基于SLAF-seq技術(shù)的遺傳圖譜繪制技術(shù)路線示意圖

百邁客生物(BioMarker)成立于2009年5月，是一家高新技術(shù)企業(yè)，公司基于功能基因組學(xué)的BT+IT(高通量基因測序技術(shù)、生物信息技術(shù)、高性能生物云計(jì)算技術(shù))技術(shù)，拓展出了高通量測序、生物云平臺(tái)、質(zhì)譜檢測、智能制造四大業(yè)務(wù)板塊；擁有以博士和碩士為主體的研發(fā)、生產(chǎn)團(tuán)隊(duì)；公司自成立以來，注重創(chuàng)新發(fā)展，科研成果成果層出不窮，先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等國際著名期刊上發(fā)表高質(zhì)量合作文章近千篇，累計(jì)影響因子超過4500分。擁有國家發(fā)明專利技術(shù)60余項(xiàng)，軟件著作權(quán)近200項(xiàng)。公司擁有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的測序平臺(tái)，滿足科研工作者多種科研需求，努力打造基因產(chǎn)業(yè)國際一流企業(yè)，“為世界創(chuàng)造新的可能！”