應用目標:選取該物種1000個以上重要種質(zhì)資源進行全基因組分子標記開發(fā),篩選與重要農(nóng)藝性狀緊密關聯(lián)的候選區(qū)域,同時可以進行該物種遺傳結構分析。
已有或即將有全基因組參考序列的物種。如玉米、大豆、水稻、甘藍、白菜、高粱、黃瓜、西瓜、馬鈴薯、番茄、擬南芥、豬、牛、雞、兔子等物種。
從目標物種自然變異群體中選取核心種質(zhì),原則為:覆蓋盡可能廣的地域(不同環(huán)境及生長條件),盡可能多的農(nóng)藝性狀,盡可能全的品系(野生種、半野生種、栽培種等)。
利用單元型區(qū)域進行種質(zhì)資源挖掘的研究思路
構建目標物種系統(tǒng)發(fā)育樹
基于多態(tài)性分子標記定義目標物種不同品種間的親緣關系,繪制物種系統(tǒng)發(fā)育樹來研究其演化過程。
群體進化樹:每個節(jié)點代表一個或幾個個體,枝長代表進化距離。
單體型預測
根據(jù)連鎖不平衡理論,對所有品種中共同遺傳而很少重組的區(qū)域進行預測,通過LD分析,定義單體型。
LD圖譜:橫向為各個多態(tài)性位點在基因組上對應的位置,通過計算兩兩間的連鎖不平衡率,定義單體型。
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百邁客生物(BioMarker)成立于2009年5月,是一家高新技術企業(yè),公司基于功能基因組學的BT+IT(高通量基因測序技術、生物信息技術、高性能生物云計算技術)技術,拓展出了高通量測序、生物云平臺、質(zhì)譜檢測、智能制造四大業(yè)務板塊;擁有以博士和碩士為主體的研發(fā)、生產(chǎn)團隊;公司自成立以來,注重創(chuàng)新發(fā)展,科研成果成果層出不窮,先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等國際著名期刊上發(fā)表高質(zhì)量合作文章近千篇,累計影響因子超過4500分。擁有國家發(fā)明專利技術60余項,軟件著作權近200項。公司擁有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的測序平臺,滿足科研工作者多種科研需求,努力打造基因產(chǎn)業(yè)國際一流企業(yè),“為世界創(chuàng)造新的可能!”