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單細胞轉錄組測序是在單個細胞水平進行高通量轉錄組測序的一項新技術。
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單細胞轉錄組測序是在單個細胞水平進行高通量轉錄組測序的一項新技術，能夠有效解決細胞異質性以及bulk RNA-seq被掩蓋的細胞群內轉錄組異質性難題，有助于發現新的稀有細胞類型，深入了解細胞生長過程中的表達調控機制。
基于10x Genomics和BD RhapsodyTM平臺可以實現單個樣本數千甚至上萬個單細胞群體分析，解決傳統單細胞測序在通量或擴展性方面存在的不足，為單細胞研究開拓了新的思路。
△ 歐易生物單細胞轉錄組測序技術已通過10x Genomics CSP官方認證
技術優勢
通量高：一次可以同時測8個樣本，每個樣本最多可以檢測到上萬個細胞
周期短：17分鐘內完成上萬個細胞封裝，一天之內完成細胞懸液制備、單細胞捕獲、擴增以及建庫
捕獲效率高：細胞捕獲效率高達65 %
應用范圍廣：動物細胞和植物細胞均可以進行單細胞測序，已廣泛應用于腫瘤細胞異質性、免疫細胞群體檢測和胚胎發育研究等
10x Genomics的Chromium系統利用8通道的微流體“雙十字”交叉系統，將含barcode的凝膠珠（Gel Beads）、細胞和酶的混合物、油三者混合，形成GEMs（油包水的微體系）GEMs形成后，細胞裂解，凝膠珠自動溶解釋放大量barcode序列。
隨后mRNA逆轉錄產生帶有10× barcode和UMI信息的cDNA，構建標準測序文庫。
（1）凝膠珠進入第一個進樣口與細胞懸液和酶等混合，通過第二個進樣口時被油滴包裹，形成GEMs，隨后細胞裂解，凝膠珠溶解，進行逆轉錄
（2）油滴破裂，收集cDNA產物，進行cDNA擴增
（3）構建測序文庫進行測序
（1）樣品總量：制備成細胞懸浮液，一個樣本的細胞起始量需大于1x10 5個；
（2）樣品濃度：最終上樣前細胞濃度在700 - 1,200 cells / μL；
（3）細胞活性：活細胞數目在85 %以上；
（4）細胞大小：直徑小于40 μm；
（5）細胞培養基及緩沖液不能含有Ca 2+和Mg 2+等影響酶活性的物質；
（6）組織需解離成單細胞懸液，植物細胞需制成原生質體。
