真核生物和部分古生菌其中一個標志性特色是其染色體有著多個DNA復制起源。所有真核生物的核復制起點被定義為 “復制起源點復合物（ORC）”， ORC 通過 Cdc6 和 Cdt1 集合復制解旋酶Helicase MCM(2-7) 進行復制。研究人員發現，古硫化菌 (Sulfolobus islandicus) 的單個染色體中有著三個起源點，這些起源點有著特別的起始因子。其中兩個起源點是同源于真核生物的 Orc1 和 Cdc6，第三個起源點是同源于古生菌的 Cdt1。研究人員利用 Orc1-1 基因為非必要性這一特點，研究在離體及載體中 ATP的結合和水解在起始因子的作用。研究人員發現，Orc1-1 結合 ATP 的形式可以促進古生菌復制，這也引申 ATP 的水解會下調起源點活動。最后，研究人員表現，Orc1-1結合ATP和DNA會重塑的蛋白質的結構，而不是DNA模板。

古生菌（Archaea）乃構成生物分類的一個域。它們既與細菌有很多相似之處，比如沒有細胞核及沒有與膜結合的細胞器，但同時另一些特徵卻接近真核生物，比如存在重複序列與核小體。古生菌有其獨特的進化歷程及生化特征，所以古生菌、細菌與真核生物各為一個獨立的分類域。

因其特殊的生長條件 -- 特別是那些抵抗極端溫度 (低溫或高溫)，酸或堿度的嗜極古生菌， 研究人員對其生物酶的作用越來越感興趣，并發現許多特殊用途。例如，Pfu DNA 聚合酶 （來自嗜熱古生菌Pyrococcus furiosus）已經每天用在克隆DNA上。其它古生菌的淀粉酶，半乳糖苷酶和支鏈淀粉酶因能在超過100 ℃高溫（或高酸/ 高堿）下工作，也迅速得到科學家的注視，希望能盡快把它們應用起來，改善工業流程。在礦物加工及金屬提煉方面，嗜酸古生菌也有著非常秀麗的前景。產甲烷古生菌是污水處理的重要組成部分；另外它們也是人類和反芻動物的腸道中的重要組成部分，幫助宿主消化。 但更重要，因古生菌結構上不同于細菌，其產生的潛在抗生素貨生物活性藥物，將可能產生一種全新的藥物。