細(xì)菌感染是臨床上十分常見的感染類型。一般說來，感染性疾病的確診主要依靠傳統(tǒng)的病原學(xué)檢測(cè)，其缺點(diǎn)是檢測(cè)過程太長(zhǎng)，可能會(huì)耽誤疾病診治。疑似細(xì)菌來源的急性感染需要快速的醫(yī)學(xué)診斷和正確的抗生素治療。如果癥狀足夠嚴(yán)重，醫(yī)生通常早于正確診斷之前就選擇使用廣譜抗生素對(duì)患者進(jìn)行治療。病原學(xué)檢測(cè)通常需要幾周才能得到正確的診斷，并且只能在一部分病例中有明確的診斷。這個(gè)過程中，患者得不到準(zhǔn)確的治療，只能等待。更快、更準(zhǔn)確的病原診斷方案顯得尤為重要。

隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，16S核糖體RNA（16S rRNA）全基因測(cè)序已經(jīng)成為當(dāng)前研究微生物群落組成和分布的重要手段。通過16S rRNA基因的測(cè)序來鑒定樣本中的細(xì)菌菌株從而完成感染性疾病的病原學(xué)診斷成為可能。

最近Molecular Biology Systems公司推出一個(gè)利用超快速NextGenPCR平臺(tái)和納米孔三代測(cè)序技術(shù)相結(jié)合，在1天內(nèi)完成細(xì)菌感染病原學(xué)診斷的方案，為細(xì)菌感染性疾病患者帶來了福音。
在本方案的應(yīng)用簡(jiǎn)介中，展示了一種新的測(cè)序樣品制備方法的威力。該方案基于超快速的小于35分鐘即可完成16S rRNA全基因文庫制備的NextGenPCR基因擴(kuò)增和隨后的實(shí)時(shí)納米孔序列分析，在一天的工作流程中產(chǎn)生16S rRNA全基因序列數(shù)據(jù)。NextGenPCR®擴(kuò)增方法不需要培養(yǎng)原始樣品，因此可以應(yīng)用于臨床和環(huán)境研究中進(jìn)行快速細(xì)菌鑒定測(cè)試。
 

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