腫瘤免疫浸潤相關數據庫和工具使用技能實戰課通知
瀏覽次數:3806 發布日期:2021-11-24
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國自然研究熱點腫瘤免疫浸潤相關數據庫和工具使用-生信技能實戰課
時間:2021/12.18-12.19
線上直播,贈送回放視頻,長期答疑群
近期“腫瘤微環境、免疫浸潤分析”相關研究不僅在論文發表上,發表數量逐年遞增。從近年的國家自然科學基金資助的項目數和總金額來看,腫瘤微環境和免疫方向相關立項也是節節攀升,反映了這一研究領域的重要性。
腫瘤微環境主要由腫瘤細胞、成纖維細胞、免疫細胞、各種信號分子和細胞外基質及特殊的理化特征等共同組成,腫瘤微環境顯著影響著腫瘤的診斷、生存結局和臨床治療敏感性。
通過發揮促腫瘤作用和抗腫瘤作用,浸潤腫瘤的免疫細胞可以深刻影響腫瘤的進展以及抗癌治療的成功。因此,腫瘤浸潤免疫細胞的量化有望揭示免疫系統在人類癌癥中的多方面作用,并參與腫瘤逃逸機制和對治療的反應。
因此免疫浸潤也是近幾年腫瘤研究的一個重要方向。目前也有一些比較方便的工具幫助大家挖掘免疫浸潤,如CIBERSORT等。
那么到底熱門文獻中免疫浸潤分析是什么樣的?我們自己能不能做得出來?免疫浸潤分析的相關工具和數據庫到底有哪些,又該如何使用?
華斯泰、爾云主辦的《腫瘤微環境和免疫浸潤分析-生信技能課程》將帶領大家逐一對相關的工具和數據庫進行學習,希望大家學習之后對免疫浸潤分析有更深刻的了解,基本能夠滿足論文和基金中對于免疫浸潤分析的需求。
一、學習目的與預期
1、主流免疫浸潤分析數據庫(IMMUPORT、TISIDB、TIMER等)的熟悉掌握。
2、主流免疫浸潤分析工具(CIBERSORT、ESTIMATE、xCELL等)的熟悉掌握。
3、掌握復現高分文獻中免疫浸潤相關展示圖表的能力。
4、能夠滿足日常文章以及國自然基金免疫浸潤分析相關圖表的制作。
二、導師介紹
宋老師,從事生信分析工作多年,參與并完成了超過百個軟件著作權和發明專利的撰寫和申請,參與超過近三百個項目的設計、開發、分析環節。
研究方向:擅長GEO、TCGA數據挖掘;轉錄組、代謝組,蛋白組,16S等二代測序標準分析和定制化高級分析;長期專注于腫瘤方向生物信息數據分析,精通R語言以及各類生物信息學軟件。
主要培訓方向:《GEO數據挖掘》、《TCGA數據庫挖掘和應用》、《網絡藥理學分析》、《腸道微生物相關分析》等。
三、會議安排
時間安排 |
主要內容 |
第一天 |
9:00~10:10 |
腫瘤免疫浸潤高分生信文獻梳理
免疫浸潤知識介紹并梳理文獻的關鍵圖表 |
10:20~11:30 |
實操課∶
1、TISIDB免疫學數據庫的介紹和使用
2、IMMUPORT免疫數據庫的介紹和使用 |
14:00~15:10 |
實操課∶免疫細胞浸潤估計工具CIBERSORT實操(包括原理,數據準備,實操,結果可視化以及結果解讀) |
15:20~16:30 |
實操課∶ssGSEA 樣本基因集富集分析實操(原理,數據準備,操作和結果解讀) |
第二天 |
9:00~10:10 |
實操課∶腫瘤免疫工具 TIMER的實操以及結果解讀 |
10:20~11:30 |
實操課∶腫瘤純度算法工具ESTIMATE的實操以及結果解讀 |
14:00~15:10 |
實操課∶
1、腫瘤免疫浸潤分析工具 EPIC 使用
2、腫瘤免疫浸潤分析工具xCE 使用 |
15:20~16:30 |
課程成果檢測∶3-5分左右純生信文獻涉及免疫浸潤部分的結果復現實操。提供整理數據 |
四、培訓相關
開班時間:2021年12月18-19日
開班地點:線上直播
主辦方:華斯泰科研培訓中心
承辦方:華斯泰生物醫學科技有限公司
報名費:3200/人(可開具發票,費用包含電子版材料)
優惠政策:
1、提前報名及轉賬的,可以提前拿到學習材料
2、兩人成團報名,每人減100
3、三人成團報名,每人減200
4、參與培訓的老師,課程結束后可以獲得全套視頻
報名咨詢:
聯系人:李老師
手 機:13366403928(微信同號)
E-mail:
13366403928@163.com
報名方式:
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