生物信息學-R語言繪圖與科技論文繪圖技術實操班通知

瀏覽次數：6411　發(fā)布日期：2016-8-30　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉載請注明出處

關于舉辦“生物信息學最新技術”暨“生物信息繪圖技術與實踐”高級培訓班的通知

各有關單位:

生物信息實驗中的海量離散數據蘊含著各種顯著或潛在的規(guī)律和特征，這些規(guī)律或特征通常被淹沒在隨機信號和實驗誤差之中。將數據變?yōu)橹庇^的圖表，不僅可以形象化的展現數據中的這些規(guī)律，還能表現出數據之間存在著各種直接或間接的聯系（如包含、延伸、對照、線性等）。因此生物信息繪圖技術是在生物研究中非常重要的工具，能夠大幅提高研究者的科研效率，在實驗數據分析、科技論文寫作中不可或缺。生物信息繪圖軟件非常多，功能也各有不同，為了滿足廣大生物科技研究人員的迫切需要，北京海淀中科計算技術轉移中心（中科院計算所技術轉移中心）舉辦“生物信息學最新技術”暨“生物信息繪圖技術與實踐”高級培訓班，并由北京嘉誠永恒科技有限公司具體承辦。“智能信息處理技術”為人力資源與社會保障部中國科學院北京分院國家級專業(yè)技術人員繼續(xù)教育基地培訓點培訓項目，“生物信息”為智能信息處理技術系列培訓項目之一。具體事宜通知如下：

一、培訓目標及特點：

本培訓邀請的主講人均是有理論和實際研究經驗的人員。學員通過與專家直接交流，能夠分享到這些頂尖學術機構的研究經驗和實驗設計的思路。學員通過集中專題學習后能夠擴展思路，在研究技術方面領悟更多。

二、培訓對象：

大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫(yī)學、化學、農學、計算機科學、數學類專業(yè)的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員；科研單位從事生物、生命科學、微生物研究的相關人員；生物、醫(yī)藥、化學及相關企業(yè)的領導與技術骨干。

三、時間地點：2016年9月22日—9月26日北京

（時間安排：第1天報到，授課4天）

四、培訓內容：

一、科技論文繪圖概論	科技期刊對繪圖（figure）的具體要求和各種圖片格式及應用場景介紹；根據具體要求聯合應用Photoshop和Illustrator進行單張圖片的調整、整合和輸出；圖片細節(jié)的調整和美化，包括線條的快速調整、標尺的制作、文字的編排等；利用Mindmanager和億圖圖示專家等專業(yè)軟件進行 “思路圖”和科研項目流程圖的繪制。
二、R語言基礎	R語言簡介、功能及基本語法介紹
三、R語言功能及應用案例	R語言簡介、功能及基本語法介紹及實際操作 1）（散點圖--點線混合圖、并列散點圖、坐標對數化 2）條形圖-標準條形圖、推積條形圖、鄰接條形圖、Error Bar 形 3）圖文氏圖 4）餅圖--二維餅圖、三維餅圖 5）盒形圖--(箱線圖) 6）經驗分布圖 7）頻率直方圖 8）及熱圖（三種熱圖不同作圖方法）等的繪制
四、ggplot2的使用	掌握ggplot2繪圖相關命令，以及常見圖表（條形圖，折線圖，散點圖，直方圖以及密度圖等。添加注釋，分頁以及配色，坐標軸調整）
五、R在統(tǒng)計學中的應用	使用R做一些常用的統(tǒng)計分析。假設檢驗；回歸分析、方差分析；主成分分析、聚類分析等等（以生物、醫(yī)學和生態(tài)相關內容為例）
六、使用R語言進行生物信息學相關的分析	使用R語言相關的包對轉錄組等組學的高通量測序數據進行差異表達、富集分析等。
六、使用R語言進行生物信息學相關的分析	生物信息學專業(yè)圖KEGG、GO等的繪制方法與運用R語言進行實現
七、進化分析及作圖	基本進化樹構建方法（MEGA）,模型評估（MEGA），進化樹注釋（Evolview）
八、科技論文繪圖及修圖基礎	科技論文圖表要求；繪圖基礎知識、圖文件類型、來源與繪制方法介紹；常規(guī)繪圖與實現方法及軟件學習（powerpoint、visio、adobe illustrator等）
九、生物信息學專業(yè)常用工具及繪圖方法	運用生物信息常用的工具進行專業(yè)繪圖及格式轉換；學BioEdit、WeGO等常用生物學專業(yè)軟件的圖表及格式轉換
十、數據分析繪圖工具origin的使用	使用origin軟件進行圖形繪制、編輯以及曲線擬合等數據分析操作
十一、基因組可視化軟件circos的使用	使用circos繪制基因組圈圖