DNA甲基化分析的完整解決方案—Zymo Research
瀏覽次數:5113 發布日期:2015-4-7
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表觀遺傳學:一切皆有可能
Zymo Research – DNA甲基化分析的完整解決方案
Zymo于1994年成立于美國加州Orange County,主要研發和生產表觀遺傳學系列產品和常用分子生物學試劑盒,其DNA甲基化,羥甲基化,核酸提取等產品已得到世界各頂級實驗室的認可,產品具有“快速、簡便、超純”的特點;Zymo甲基化產品線已被上千次引用在各大主流學術刊物上,包括NATURE、SCIENCE 、PNAS、Stem Cells、 Nucleic Acids Res等;迄今,EZ DNA Methylation™系列產品作為DNA重亞硫酸鹽處理(DNA甲基化分析前處理)的的金標準,已成為最暢銷和引用次數最多的產品;
全球最受好評的重亞硫酸鹽轉化試劑盒
產品1 - EZ DNA Methylation™ Kits (轉化率>99%)
- 該試劑盒已被Illumina, Sequenom, Nimblegen,Agilent,Roche等公司整合入其標準化工作流程中
品名 |
規格 |
貨號 |
EZ DNA Methylation™ Kit (柱子) |
Column, 50 Rxns, 200 Rxns |
D5001, D5002 |
EZ-96 DNA Methylation™ Kit (96孔板高通量) |
Shallow-Well, 2 x 96 Rxns Deep-Well, 2 x 96 Rxns |
D5003, D5004 |
EZ-96 DNA Methylation MagPrep (高通量磁珠法) |
4x96 rxns, 8x96 rxns |
D5040, D5041 |
產品2 - EZ DNA Methylation™-Gold Kits (轉化率>99%)
- 該試劑盒是目前最受歡迎的重亞硫酸鹽轉化試劑盒,小于3小時轉化時間
品名 |
規格 |
貨號 |
EZ DNA Methylation-Gold™ Kit (柱子) |
50 Rxns, 200 Rxns |
D5005, D5006 |
EZ-96 DNA Methylation-Gold™ Kit (96孔板高通量) |
Shallow-Well, 2 x 96 Rxns Deep-Well, 2 x 96 Rxns |
D5007, D5008 |
EZ-96 DNA Methylation-Gold MagPrep (高通量磁珠法) |
4x96 rxns, 8x96 rxns. |
D5042, D5043 |
產品3 - EZ DNA Methylation™-Direct Kits (轉化率>99.5%)
- 該試劑盒可直接以細胞(≥10個細胞),血液和組織(FFPE)作為起始模板,并適合低樣本起始量(10個細胞 或 50pgDNA)
品名 |
規格 |
貨號 |
EZ DNA Methlyation-Direct™ Kit (柱子) |
50 Rxns, 200 Rxns |
D5020, D5021 |
EZ-96 DNA Methlyation-Direct™ Kit (96孔板高通量) |
Shallow-Well, 2 x 96 Rxns Deep-Well, 2 x 96 Rxns |
D5022, D5023 |
EZ-96 DNA Methylation-Direct MagPrep (高通量磁珠法) |
4x96 rxns, 8x96 rxns. |
D5044, D5045 |
產品4 - EZ DNA Methylation™-Lightning Kits (轉化率>99.5%)
- 該試劑盒可達最快的1小時處理時間,徹底完成DNA的轉化
品名 |
規格 |
貨號 |
EZ DNA Methlyation-Lightning Kit(柱子) |
50 Rxns, 200 Rxns |
D5030, D5031 |
EZ-96 DNA Methylation-Lightning Kit(96孔板高通量) |
Shallow-Well, 2 x 96 Rxns Deep-Well, 2 x 96 Rxns |
D5032, D5033 |
EZ-96 DNA Methylation-Lightning MagPrep(高通量磁珠法) |
4x96 rxns, 8x96 rxns. |
D5046, D5047 |
圖注:經重亞硫酸鹽處理后的DNA測序表明:位點5的甲基胞嘧啶保持不變,而未甲基化的胞嘧啶(如:位點7,9,11,14和15)在重亞硫酸鹽處理后被完全轉化為尿嘧啶,并在PCR擴增后以胸腺嘧啶被檢測到。產品5 - EZ RNA Methylation Kit (轉化率>99%)
品名 |
規格 |
貨號 |
EZ RNA Methylation Kit |
50 prep, 200 prep |
R5001, R5002 |
- 該產品為首款商品化的RNA重亞硫酸鹽轉化試劑盒
- 配套Zymo Direct-zol™ RNA MiniPrep (Cat.No. R2050, R2052) 使用,效果杠杠的!
- 轉化得到的RNA可用于RT-PCR, sequencing, library preparation and Next-Gen sequencing等
優質DNA標準品 - 精確定量DNA甲基化程度
Universal Methylated DNA Standards
- 使用甲基化和未甲基化DNA對照,精確測定重亞硫酸鹽轉化效率
- 與Zymo所有重亞硫酸鹽轉化產品兼容
品名 |
規格 |
貨號 |
Human Methylated & Non-Methylated DNA Set |
1 Set |
D5014 |
Human WGA Methylated & Non-Methylated DNA Set |
1 Set |
D5013 |
Universal Methylated Human DNA Standard |
20rxns |
D5011 |
Universal Methylated Mouse DNA Standard |
20rxns |
D5012 |
圖注:使用M.Sssl 甲基化酶測定的完全甲基化。來源于HCT116 DKO細胞的非甲基化和甲基化的DNA經Mspl 和 Hpall 限制性內切酶消化處理。Mspl可消化非甲基化和甲基化的DNA,而Hpall只能消化非甲基化DNA,無法消化CpG的甲基化。 5-mC & 5-hmC ELISA Kits -靈敏的5-mC和5-hmC定量
- 適用于基因組DNA中5-mC和5-hmC的高通量全局檢測
- 整個工作流程最快可在3小時內完成
品名 |
規格 |
貨號 |
5-mC DNA ELISA Kit |
1 x 96 Preps 2 x 96 Preps |
D5325 D5326 |
Quest 5-hmC™ DNA ELISA Kit |
1 x 96 Preps 2 x 96 Preps |
D5425 D5426 |
圖注:5-mC DNA ELISA Kit可定量檢測來自于眾多樣本來源DNA中 5-mC程度(%),其結果與LC-MS檢測樣本結果密切關聯。
其他甲基化研究相關試劑
品名 |
規格 |
貨號 |
Anti-5-Methlycytosine Monoclonal Antibody |
15 ul, 30 ul, 50 ul, 200 ul@ 1 ug/ul |
A3001-15,A3001-30,A3001-50,A3001-200 |
Anti-5 hmC Polyclonal Antibody |
25ug/25ul, 50ug/50ul, 200ug/200ul |
A4001-25, A4001-50, A4001-200 |
Methylated – DNA IP Kit |
10 Rxns |
D5101 |
OneStep qMethyl™ Kit |
44 tests |
D5310 |
OneStep qMethyl™ - Lite |
44tests |
D5311 |
Quest 5-hmC Detection Kit (includes Mspl GSRE) |
25 preps, 50 preps |
D5410, D5411 |
Quest 5-hmC Detection-Lite Kit (GSRE not included) |
25 preps, 50 preps |
D5415, D5416 |
Quest 5-hmC DNA Enrichment Kit |
25 rxns. 50 rxns. |
D5420, D5421 |
CpG Methylase (M.Sssl) |
200U, 400U |
E2010, E2011 |
CpG Methylase (M.CviPI) |
200U, 1000U |
E2014, E2015 |
5-hmC Glucosyltransferase |
100 units, 200 units |
E2026, E2027 |
ZymoTaq DNA Polymerase |
50 rxns. 200rxns |
E2001, E2002 |
ZymoTaq PreMix |
50 rxns. 200rxns |
E2003, E2004 |
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常見問題解答:
Q:在用Zymo的重亞硫酸鹽試劑盒處理前,起始DNA樣本應該儲存在TE,水,還是其他緩沖液中?
A:水和TE緩沖液均可用來儲存DNA,并且不會對轉化過程造成干擾。
Q: 為什么使用EZ DNA Methylation-Direct Kit,我的DNA沒有得到完全的轉化?
A: 1) 如果是固體樣本,很可能是處理的樣本量過大,而導致不完全DNA轉化;
2)如果是FFPE組織樣本,有可能是DNA已大規模受損以及/或者交聯,導致不完全轉化;
3)如果在Proteinase K消化后,沒有通過離心去除碎片,則可能會干擾重亞硫酸鹽轉化過程,導致DNA的不完全轉化;
Q: 為什么EZ-96 DNA Methylatioin 甲基化(96孔板)產品線有兩種不同的目錄號?
A: 這兩種不同的目錄號是用來區分試劑盒內不同類型的96孔板。深孔板和淺孔板均適用于大多數離心機和微板架。如下闡釋了這兩類96孔板的區別:
|
Silicon-A |
Zymo-Spin I-96 |
款式 |
淺孔 |
深孔 |
尺寸(H x W x L) |
19 mm x 83 mm x 125 mm |
35 mm x 83 mm x 125 mm |
結合/收集板組合高度 |
43 mm |
60 mm |
結合力/最小洗脫體積 |
5µg/30µl per well |
5µg/15µl per well |
貨號 |
D5003, D5007, D5022, D5032 |
D5004,D5008, D5023, D5033 |
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Q: Zymo 重亞硫酸鹽處理試劑盒與illumina技術平臺兼容嗎?
A: 是的,Zymo的EZ DNA Methylation Kit技術被illumina推薦使用在其GoldenGate和Infinium Assays平臺上;
Q: 用Zymo的EZ DNA Methylation Kit轉化得到的DNA可用作哪些下游分析應用?
A: 用Zymo的任何一款EZ DNA Methylation kit轉化得到的DNA,可完美適用于后續的各類權威測序分析法,Ms-SNuPE, COBRA, Bisulfite-PCR, MSP, Bisulfite-sequencing, mass spectroscopy (如: Sequenom的EpiTYPER), 以及其他分析方法。
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