開班時間：2013年12月8日至12月15日
上課內容：基因組學、蛋白質組學、系統生物學

 

培訓地點：杭州 浙江大學華家池校區
收費標準：注冊費為￥3000/人，安排食宿、費用自理。

上機實習內容：
1.基因組數據注釋和分析； 2.核苷酸序列分析； 3.蛋白質結構與功能分析； 4.芯片數據的基本處理和分析； 5.蛋白質組學數據分析； 6.系統生物學軟件實習-網絡結構顯示與分析。

隨著眾多生物基因組測序項目的完成，生物學數據正在加速度增長。如何科學地分析和注釋這些高通量數據，已成為生物學工作者急需學習和解決的問題。 我們將為您提供學術殿堂，請您參加我們舉辦的“基因組科學”研習班。這里您將可以聽到于軍教授（注：于軍被《科學美國人》評為2002年度世界科學領袖）親自主講的基因組學基礎知識和前沿進展。楊軍、陳銘教授分別主講系統生物學和蛋白質組學的研究方法和思路。

我們也將為您邀請經驗豐富的胡松年等教授給您細說基因轉錄組的測定及分析、基因芯片、新一代測序等實驗技術的關鍵事項。如果您正在從事研究工作并想進一步提升科學研究水平，不妨來這里傾聽浙江大學鄭樹教授、楊軍教授、薛慶中教授分別述說在醫學和農學應用中的經驗和體會。

如果您想學習從互聯網公共數據庫獲取數據、處理數據的方法，從中挖掘有價值的信息資源，您更應該來參加我們舉辦的“基因組科學”研習班。我們將為您提供優質服務，每人一臺PC機，讓您緊隨大屏幕演示“跟我學”操作。上機實習課6次，帶您進入基因組科學大門，輔導您運用網上的軟件和工具，繪制進化樹，探討物種起源；從錯綜復雜的網絡中，梳理分子間的相互作用。6天短暫的學習肯定會讓您學有所獲。我們還給您提供科學出版社發行的最新教材，便于自學、溫故知新、復習鞏固。

凡來參加過學習的學員都夸我們的研習班工作認真負責，給學員們提供了極好的“充電”機會。至今我們已舉辦40期，每期150人左右，學員遍布全國30余個省市。每次研習班都有近20名教授、研究員參加，更多是碩士生、博士生等年輕學者。他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯系；也有的通過研習班建立了協作關系，共同申請課題，發表論文，其中不少優秀的研究成果，已在SCI期刊上發表。

不學不會，早學早會。有志或有興趣學習基因組、蛋白質組、系統生物學的科研工作者、高校教師及研究生，熱烈歡迎您前來杭州參加“基因組科學”研習班。

 

上課內容涵蓋“基因組學－>蛋白質組學－>系統生物學”的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。主要內容如下：
1. 基因組的比較研究、DNA測序技術原理與進展（講課人：于 軍 教授）
2. 基因轉錄組的測定及分析、大規模測序方法及應用、微生物基因組學（講課人：胡松年教授）
3. 蛋白質組學和系統生物學應用及數據分析（講課人：楊軍、陳銘教授等）
4. 基因組學、蛋白質組學、系統生物學在醫學、農學中的應用 （講課人：鄭樹、薛慶中、鐘伯雄教授）

 

上機實習課采用 “跟我學”方式，學習生物信息學軟件使用，每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數據分析的基本方法。主要內容如下：

實習一： 基因組數據注釋和功能分析
    通過序列比對工具BLAST的學習，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4，掌握系統發生樹繪制的基本方法，認識基因復制在進化上的功能。

實習二： 核苷酸序列分析
    學習基因序列分析常用的數據庫和軟件，包括：基因預測，編碼區結構分析，選擇性剪切分析，基因啟動子預測，基因調控元件預測，密碼子偏好性分析等內容。

實習三： 芯片的基本數據處理和分析
    使用TM4軟件來實現芯片的數據采集，低質量過濾，標準化處理及聚類等可視化分析；使用GenMAPP軟件挖掘芯片數據在代謝途徑中的生物學意義；介紹NCBI GEO數據庫，學習檢索和提交芯片數據。

實習四：蛋白質結構與功能分析
    從數據庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始，接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析，預測目標蛋白的生物功能。

實習五： 蛋白質組質譜分析
    使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質質譜數據，將質譜結果匹配到蛋白質組數據庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進行統計學分析和優化檢索結果練習。

實習六：系統生物學軟件實習-----網絡結構顯示與分析
    利用Cytoscape系統生物學分析軟件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子網絡系統，并與基因表達等數據整合。

 

    從事生命科學、農學、醫學等領域科研工作者和高校教師及研究生。

 

    若對本期研習內容有興趣，請將以下報名表回執（點擊下載）發送E-mail到gjsu2012@163.com。我們會立即回信，并登記在冊，待排定課表后發給您詳細教學日程表（每節課時間、講課主題、講課人等）。待您確認后，發給您報到通知并排定上機號。

 

 

    “DNA和蛋白質序列數據分析工具”（第三版）， 薛慶中等編著，科學出版社出版 2012年6月發行

 

聯 系 人： 周老師

傳    真： 13611816758

郵    箱:  gjsu2012@163.com

               浙江大學浙江加州國際納米技術研究院
             中國科學院北京基因組研究所
            2013年10月10日