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生物信息學基礎語言-perl語言10月開班通知

瀏覽次數：15498　發布日期：2013-10-10　來源：本站　本站原創，轉載請注明出處

Perl語言作為絕大多數生物信息學工作者首選語言之一。北京市計算中心生物計算事業部針對沒有任何計算機語言的生物學、醫學、農學等人員，且有從事生物信息學工作相關研究工作的需要。歡迎您報名參加！

主辦單位：北京市計算中心，生物計算事業部

舉辦地：北京，北京市海淀區豐賢中路7號北科產業3號樓

培訓時間：2013年10月22日-25日

報名截止：2013年10月22日

培訓內容及安排：

日期	授課題目	授課內容
第一天	生物信息學與Perl語言概述	概括介紹生物信息學背景與Perl語言的概念及特點
	軟件安裝與運行環境調試	Perl語言解釋器、編輯器安裝，Perl程序運行測試
	基本操作與基本概念	DOS、Unix命令行操作基本命令；Perl語言基本變量與操作符
	基本變量	變量、字符串賦值、基本運算等練習
第二天	基本語法結構	判斷結構；循環結構；練習
第二天	數組及應用	數組的概念及用法；練習
第三天	文件與文件夾操作	文件的讀入與輸入；文件夾操作；練習
	二維數組與hash表及應用	二維數組概念、關聯數組(hash表)概念及用法；練習
	常用函數及子程序	常用Perl語言基礎函數學習；子程序概念與應用；練習
第四天	正則表達式及生物信息學Perl程序實例	Perl特色功能正則表達式學習與應用；生物信息學實例程序學習；練習
第四天	Bioperl簡介、CPAN簡介、常用生物信息學數據庫與軟件簡介	Bioperl簡介與安裝；Perl第三方代碼庫CPAN簡介；常用生物信息學數據庫簡介、數據類型與應用；常用生物信息學軟件數據格式及軟件應用簡介
授課實例	1、生物學數據文件批量的合并、分隔、去冗余等。 2、生物信息序列數據fastq、fasta、genbank文件等格式轉換與批量自動化處理。 3、按個性化實驗需求，從生物信息學數據庫文件（如genbank、EMBL）中批量自動化提取特定數據信息。 4、表格矩陣型數據的行列轉換、特定數據信息的自動化過濾與數據篩選等。 5、二代測序原始數據的批量過濾處理，如barcode識別、質量值過濾等。 6、基因、蛋白質序列特定位點的識別，如起始、終止位點、ORF、motif、CDS等。 7、生物信息學數據序列特征提取與自動化統計，如GC百分含量、k-mer統計、基因反向互補轉換等。 8、生物信息學數據庫文件的批量自動化下載與信息提取（選學）。

（此表僅供參考，授課內容以實際授課為準）

【培訓特色】

1、對口生物信息； 2、非嚴格語法，適合初學；

3、功能強大、跨平臺；4、有巨大的第三方代碼庫CPAN

【報名費用】注冊費：2800元/人（含聽課費、資料費、上機費、午餐，請自帶筆記本電腦以備上機實踐使用），主辦方可協助安排入住酒店，住宿費用自理。

【付費方式】現金、支票、銀行轉賬、銀行匯款

單位全稱：北京市計算中心賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息里備注上：“生物計算事業部培訓費——您的姓名”）

【報名優惠政策】

1、開課前20天報名的學員每人可減少200元（10.2以前）；

開課前10天報名的學員每人可減少100元（10.12-10.2）；

2、 3人以上團體報名的學員每人可減少200元；

3、任意兩班同時報名可減少300元（需一次性繳費）；

4、 4+1團報，可免費贈送一個名額

5、上面4種優惠政策不能同時享受，只能享受其中一種。

6、老學員、老學員介紹的學員均可以再優惠100元。

培訓以收到學員培訓費為成功報名，培訓座位按收到費用先后順序安排。

【注意事項】

1、已經成功付款的學員，如在開課前7個工作日前聯系主辦方撤銷席位，可退還100%的注冊費用；如在開課前3個工作日內（含3個工作日）要求撤銷席位則退還80%的注冊費用。

2、撤銷席位后，學員可提交延期申請，可參加當前時間到2013.12.12日期間由北京市計算中心舉辦的各類培訓，費用將采取多退少補原則。逾期不參加任何培訓課程可申請退款，退款期間產生的所有費用由學員本人承擔

【請聯系】張利英 010-59341771 ，18618295767，QQ號：2814500767，郵箱：zhangly@bcc.ac.cn

員麗麗 010-59341773, 18701529461 , 郵箱：yuanll@bcc.ac.cn

報名回執表:

培訓班類型：（可多選）

□實用生物信息學培訓班 □論文發表所需的圖表處理實用技能

□生物信息與宏基因組分析專題研討班 □Perl語言專題班

姓名：

性別

民族：

職稱：

身份證號

工作單位：

住宿：

是□；否□

研究方向：

報名時間：

通訊地址：

郵編：

固定電話：

手機：

E-mail:

報名種類：

A□ B□ （該選項僅報名生物信息培訓班人員填寫）

對課程了解情況

☆☆☆☆☆

感興趣的課程：

信息渠道:

□中心主頁 □郵件宣傳（張利英、員麗麗）□海報 □單頁 □銷售員 □丁香園 □生物論壇 □生物通郵件、主頁 □朋友推薦 □老學員推薦（姓名）

□是否有優惠卷

發票抬頭：

發票內容：

住宿明細

入住時間：

離店時間：

房間類型

□大床間

□標準間（和合住）

□拼房（與其他學員拼標準間）

備注：

確定報名后，請將回執表發到上述聯系人郵箱里。如在兩日內沒有收到回復，請電話聯系確認。如對課程有特殊需求的，請將需求發到上述聯系人郵箱。

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