羅氏454測序用于野生雙峰駝基因組圖譜繪制

瀏覽次數：2863　發(fā)布日期：2012-11-22　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉載請注明出處

羅氏454測序用于野生雙峰駝基因組圖譜繪制

中國及中亞細亞溫帶荒漠地區(qū)的駱駝均為雙峰駱駝(Bactrian camel)，中國的雙峰駝集中分布于內蒙古西部、寧夏、新疆、甘肅的溫帶荒漠和荒漠草原區(qū)，占全國總駝數的95%。且中國尚有數量比大熊貓還少的世界珍稀瀕危動物—野生雙峰駝存在。內蒙古阿拉善盟是中國駱駝最多的地區(qū)，擁有雙峰駝10萬峰以上，約占全國駱駝總數的33%、世界駱駝總數的25%，素有“駝鄉(xiāng)”之稱。這里出產的阿拉善雙峰駝以其體型大、絨質好等特點被確定為國家優(yōu)良畜種，它具有耐粗飼、耐饑渴、耐高溫、耐嚴寒、耐負重、抗干旱、抗風沙、抗疾病等特殊能力。

最近國內大學研究者們攜手國內生物信息學專家們在Nature Communication上發(fā)表文章¹，報道完成了野生雙峰駝2.01Gb的基因組草圖，并揭示了野生雙峰駝能在極其嚴酷的環(huán)境下生存的秘密。利用454 GS FLX測序系統(tǒng)及短平臺進行了混合拼接，得到了120,352條scaffold，其中13,544條scaffold超過1 kb，3,453條scaffold超過10 kb，大于1kb的scaffold N50達到了2 Mb。預測編碼基因20821個，平均含8個外顯子，平均編碼區(qū)長1322 bp，編碼區(qū)GC含量達52%，顯著高于全基因組GC含量41%。

通過對編碼基因的考察，研究人員們發(fā)現(xiàn)雙峰駝的代謝通路調節(jié)方面的基因快速進化，因此在食物消化后的吸收與常規(guī)反芻動物完全不同。另外，雙峰駝可承受大量血糖也與部分基因改變有關，而這些基因正是與人類II型糖尿病相關的基因。對這些基因進一步的研究可能幫忙解開人體中胰島素調節(jié)以及糖尿病發(fā)生機制。在人體中中CYP2J基因控制高血壓，然而雙峰駝體內含有多個該基因的拷貝，使其即使在吃了大量鹽的情況下仍能保持較低的血壓。

1. Jirimutu. et al. Genome sequences of wild and domestic bactrian camels. Nat. Commun. 3:1202 doi: 10.1038/ncomms2192 (2012).

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