羅氏454測序完成倭黑猩猩基因組草圖測序
瀏覽次數:2448 發布日期:2012-8-10
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羅氏454測序完成倭黑猩猩基因組草圖測序
近期,一個國際研究小組在《Nature》1雜志報道倭黑猩猩(Bonobo)基因組測序完成。利用完成的倭黑猩猩基因組圖譜,以及另外19個倭黑猩猩及黑猩猩(Chimpanzee)基因組的測序數據,研究人員不僅研究了倭黑猩猩的基因組,也對不同倭黑猩猩、黑猩猩及人類基因組進行了比較。
研究人員首先利用454測序系統對一只來自剛果Leipzig動物園的雌性倭黑猩猩基因組進行測序,獲得了2.7Gb的序列,拼接出倭黑猩猩的基因組圖譜,其正確可達為99.98%,與現有的黑猩猩基因組數據質量相似。
結果印證了之前對非洲猿(ape)進化史的認識,即倭黑猩猩及黑猩猩祖先約100萬年前在中部非洲分離,晚于非洲猿與人類祖先分化數百萬年。倭黑猩猩基因組的99.6%與黑猩猩基因組一致,而與人類基因組的一致度略低在98.7%。研究人員推測倭黑猩猩與黑猩猩的分化事件發生在150-120萬年前剛果河形成的時期,這也使得這兩個物種被分割開因而沒有再發生種間交配。
同時,此次研究也給人類及非洲猿進化歷史帶來了新的線索,比如在人類的基因組中也存在一些區域,相比倭黑猩猩與黑猩猩基因組兩者之前的差異,人類基因組序列可能更接近于倭黑猩猩或黑猩猩的序列。這樣的區域總量超過人類基因組的3%以上,其中約1.6%的基因組人類與倭黑猩猩更相似,約1.7%的基因人類與黑猩猩更為相似,推測可能這些區域與倭黑猩猩及黑猩猩進化歷史上發生的重大的群體性選擇事件相關。
倭黑猩猩和黑猩猩在許多高級、復雜的性狀特征上與人類有相似之處,如群體組織、社交行為;倭黑猩猩性格活潑并性行為活躍,而黑猩猩更具有攻擊性和競爭意識。研究人員下一步將通過對三者基因組異同及基因的特征特點的分析,推測在進化中關鍵的基因組事件,進而將一些包括行為學特征在內的性狀與基因特征相互關聯,以幫助解答這些性狀的遺傳學基礎的問題。
1. The bonobo genome compared with the chimpanzee and human genomes. Prüfer K. et al. Nature. 2012 Jun 28;486(7404):527-31.