羅氏GS FLX+系統完成西班牙耐藥菌基因組測定
羅氏GS FLX+系統完成西班牙耐藥菌基因組測定
一個西班牙醫院近期發生Klebsiella pneunomiae細菌的暴發事件，研究人員分離了三個具有耐藥性的Klebsiella pneunomiae菌株，并利用羅氏454 GS FLX+系統獲得了其基因組序列，這些數據補充了該細菌屬的少量已知基因組信息，為其相關的耐藥性研究、基因組進化研究提供了新的依據，同時為該細菌在此次醫院內爆發事件提供新線索。Klebsiella pneunomiae常見于人類口腔以及胃腸道內，大多數情況下并不會引發疾病。但是其基因的某些突變會引起多種類型的感染，同時這一細菌也被發現具有很強的獲得耐藥性突變的能力。該西班牙醫院的微生物部門獲得的三個Klebsiella pneunomiae菌株在GS FLX+平臺上完成測序后用儀器自帶的GS De Novo拼接軟件進行基因組拼接，并進行基因功能注釋，結果發現這些細菌出現了很多耐藥性方面的基因組進化，使得醫院內常用的許多抗生素對其失效。
通過這幾個菌株基因組的比較研究，為Klebsiella pneumoniae細菌的抗藥性研究提供了大量信息，也為在全球范圍內減少抗藥性細菌出現的努力提供幫助。通過與其他細菌基因組的比較，可以進一步了解微生物如何從對人類無害變成具有致病威脅的菌株。
現在的微生物醫學研究正隨著測序技術的不斷更新發展向新的方向，快速定性、定量研究微生物是目前的一大趨勢，而454的GS FLX+以及GS Junior系統為微生物檢測、基因組測序拼接、比較基因組研究提供了強大的支持。
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