羅氏 454 REM e 系統(tǒng)推出新emPCR自動化富集方案
羅氏 454 REM e 系統(tǒng)推出新emPCR自動化富集方案
最近，一個新的羅氏 454測序emPCR自動化富集方案成功地在 Hamilton MICROLAB STARlet
自動化移液平臺上得以實現(xiàn)。這一實驗方法利用羅氏的REM e移液系統(tǒng)，一次實驗可以處理多達八個樣本的乳液PCR產物磁珠法富集，并完成測序引物退火，直接銜接在羅氏454 GS FLX的測序實驗。這一綜合性的自動化系統(tǒng)一步完成了多個富集步驟，減少人為操作可引起的誤差，使得實驗結果穩(wěn)定，并大大縮短實驗時間。
自動化移液平臺上得以實現(xiàn)。這一實驗方法利用羅氏的REM e移液系統(tǒng)，一次實驗可以處理多達八個樣本的乳液PCR產物磁珠法富集，并完成測序引物退火，直接銜接在羅氏454 GS FLX的測序實驗。這一綜合性的自動化系統(tǒng)一步完成了多個富集步驟，減少人為操作可引起的誤差，使得實驗結果穩(wěn)定，并大大縮短實驗時間。454測序需要對制備的文庫進行乳液PCR，對包含單克隆序列的測序珠進行擴增，其后需要分解改乳液體系，并對體系中的測序珠進行洗滌以及富集。在洗滌及富集過程中，需要進行反復的移液、離心、顛倒試管、磁力吸附等操作。這一自動化解決方案即替代了這一人工操作過程，只需少量的設置程序以及放置試管試劑的步驟就可以在無人情況下完成所有步驟，節(jié)省約五個小時左右的人工操作。單次自動化實驗也只需3.5小時左右，相比人工實驗，節(jié)省了測序實驗的總時間。
一共有五種不同的自動化實驗設計，配合不同的樣本數(shù)量及體積。在Hamilton STARlet自動化移液臺上，可以準確設定羅氏REM e系統(tǒng)位置，以及其配套試管架的位置，實驗所需放置的試管及試劑的種類和數(shù)量也在新的實驗手冊中進行了詳細描述。羅氏的REM e系統(tǒng)可以進行震蕩、真空抽濾、磁珠捕獲及加熱等實驗操作。Hamilton STARlet移液平臺通過1000微升的獨立移液系統(tǒng)移動液體。
羅氏454公司將進一步與該自動化移液平臺公司合作開發(fā)配合GS Junior系統(tǒng)的自動化解決方案， 可在Hamilton的STAR系列及NIMBUS系列自動化移液平臺上實現(xiàn)。小型的NIMBUS工作站與GS Junior臺式測序儀結合，使得測序總量較小的客戶能夠獲得完整而低資金投入的自動化解決方案。
此外，除了上述自動化移液平臺外，羅氏的REM e系統(tǒng)也可以裝載在其他移液平臺上如Biomek及Tecan系列平臺等。
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