采用Arraystar lncRNA芯片發現病毒型肝癌的新靶點
瀏覽次數:4001 發布日期:2011-8-3
來源:上海康成生物
第二軍醫大學孫樹漢教授課題組長期致力于肝癌研究,許多實驗成果已經發表在國際頂級期刊上。此次研究利用Arraystar lncRNA芯片(長鏈非編碼RNA芯片)對肝癌及癌旁組織進行系統性篩查,發現lncRNA-HEIH在乙型肝炎病毒(HBV)導致的肝癌(HCC)發生中起重要作用,研究成果發表在Hepatology。
此次研究中lncRNA芯片實驗在康成生物公司完成。
Yang, F., et al., Long non-coding RNA high expressed in hepatocellular carcinoma (lncRNA-HEIH) facilitates tumor growth through enhancer of zeste homolog 2. Hepatology, 2011. (影響因子:10.885)
文章首先通過Arraystar公司的LncRNA芯片對HBV導致的肝癌組織(n=5)及癌旁組織(n=5)中的長鏈非編碼RNA進行了系統的檢測與比較,并且通過50對標本的進一步qPCR驗證,找到了一組癌與癌旁中差異表達的lncRNA。實驗者特別關注一個在癌組織中特異性高表達的新LncRNA(lncRNA-HEIH:lncRNA High Expression in HCC)。
實驗者進一步研究lncRNA-HEIH與肝癌之間的功能聯系。通過與病人生存時間等臨床數據進行關聯分析,發現lncRNA-HEIH的表達水平可以作為病人生存時間的預測標志,并且和癌癥的復發有很強的相關性。對lncRNA-HEIH的功能研究發現它在細胞周期調控中起重要作用,它可能通過與EZH2結合來募集PRC2,進而抑制下游靶基因的表達從而發揮其調控功能。這些結果表明lncRNA-HEIH有望成為病毒型肝癌的一個新的早期診斷標志或治療靶點。
圖示:肝癌(n=5)和癌旁組織(n=5)的芯片聚類結果。Arraystar公司的lncRNA芯片同時設計了mRNA與lncRNA,圖A為差異表達的254個mRNA聚類結果,圖B為差異表達的174個lncRNA聚類結果。紅色代表上調,綠色代表下調。