九叔归来3魁蛊婴在线观看_男人躁女人到高潮AV_香港成人论坛_亚洲精品久久久久久偷窥_夜来香成人网_亚洲制服 视频在线观看_无毒黄站_国产传媒18精品A片一区_麻花豆传媒剧国产MV在线观看_东北60岁熟女露脸在线_国产高清视频在线观看97_一道本视频一二三区_yellow免费播放在线观看_浪漫樱花动漫在线观看官网_高清AV熟女一区_天堂在线www_亚洲第一成年人网站_黄色在线免费观看_av女优快播_久久精品99国产精品日本

English | 中文版 | 手機版 企業登錄 | 個人登錄 | 郵件訂閱
當前位置 > 首頁 > 行業資訊 > 新品 > 關注臨床應用,454推出HLA分型檢測研究產品

關注臨床應用,454推出HLA分型檢測研究產品

瀏覽次數:3464 發布日期:2011-5-5  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處
                  關注臨床應用,454推出HLA分型檢測研究產品                               
—Julia Karow,2011-4
      
        2011-4,Roche 旗下454生命科學推出了高分辨率和中等分辨率的HLA基因分型試劑盒。
       人類白細胞抗原(HLA)所在位點編碼超過200個基因,在免疫系統中有著關鍵作用。HLA具有高度多態性,包括約6000個已知的等位基因。HLA基因型與自身免疫、傳染疾病以及一些癌癥都有聯系,此外HLA分型對器官移植中的供體和受體配型也有重要作用。
        454的兩套試劑盒,即GS  GType HLA MR 和 HR,目前只能用于研究。它們是454分析系列計劃里第一個應用于疾病領域的產品,未來產品系列中還將包括免疫遺傳學、傳染病以及癌癥。
        據公司介紹,相對于傳統的Sanger法測序,基于454測序技術平臺的HLA分型,擁有更高的通量,每次運行(run)可平行處理5-80個樣品;以及可以精確的對目的外顯子區域進行高覆蓋度的測序,從而得到樣本間的多態性數據,從而節省了時間和勞力。      
        454 CEO Chris McLeod指出,HLA分型僅在疾病研究中就“大有作為”,在法醫、群體遺傳學等其它領域,也有發展潛力。他提到,目前的分辨率水平對于許多研究應用都是非常有益的,今后要做的就是在這個基礎上開發有潛力的注冊產品,應用于臨床。
        Roche公司還未宣布何時計劃向美國食品和藥物部門提交應用申請,但是,Chris McLeod 也指出旨在提交的測序平臺及其分析的申請也是基于現行的研究版本。許多HLA分型的臨床應用中,分析的分辨率都要求比現在的更高。臨床上的測序平臺“不會是全新的,”而是當前最穩定的。
        McLeod指出目前臨床HLA分型主要是Sanger 測序法,雖然還沒有注冊的診斷產品存在,但對于454也是個“目標市場”。
        上個月,Life Technologies宣布已開始使用一款Sanger 毛細血管測序儀即3500 Dx遺傳分析儀進行了HLA分型的臨床試驗,并計劃向FDA(CSN 3/22/2011)申請510(k)平臺空間及分析試劑盒。
        McLeod指出臨床HLA檢測將會是454的市場,“在這個領域,我們比Sanger 測序有著顯著的優勢。”與其它的二代測序平臺相比,454相對的長讀長對準確確定等位基因相位更有用。“由于其它平臺的讀長不足夠長,因此實際中他們需要做許多工作,”他說。454和羅氏與合作研究者已進行了HLA分析檢測,并于上個月在Tissue Antigens公布了研究結果,其中合作機構包括斯坦福大學、德國德累斯頓技術大學、費城兒童醫院、奧地利紅十字輸血服務、奧克蘭兒童醫院和研究中心以及德國凱撒斯勞滕免疫及遺傳學協會。
        奧克蘭兒童醫院和研究中心HLA & Immunogenetics實驗室負責人,也是文章作者之一,Elizabeth Trachtenberg 談到454平臺一個主要優勢,就是減少等位基因雜合子對計算多態性頻率的影響。而使用 Sanger 測序,“我們必須做許多補充測驗去解決這些模糊的雜合子組合,而這個新的克隆法測序大大簡化了該問題,”她這樣告訴Clinical Sequencing News,“ 我們至少要花費四分之一的時間去解決含糊性,而454平臺確實給HLA臨床試驗提供了很大的幫助”。 每個樣品的成本也“明顯少于Sanger測序法,”她補充到,因為許多樣品可以平行操作,同時模糊性被降低,盡管她還沒有完全精確計算成本,目前她的實驗室每次同時進行40個樣品11個位點的測序。
        可以肯定的是,雖然Trachtenberg的 454 GS FLX是在CLIA實驗室運行,但它不是用于臨床工作而僅是疾病研究。“但是隨著時間推移,我們將來會把它應用于臨床試驗和處理病人樣品,”她說,甚至可能在FDA同意454儀器之前。倘若不能使用羅氏的試劑盒進行臨床研究,她可能自己研發試劑。
 
        兩年前,一些HLA檢測實驗室一直懷疑使用454平臺進行臨床HLA分型,復雜且工作量大的樣本準備,讀長有限而不能進行外顯子之間的多態性分析,此外還需要在一次運行中集合許多樣本,以使得分析在成本上更高效(IS 3/17/2009)。
        McLeod表明,公司已和使用者合作研究液態控制系統,自動化準備樣本。此外,兩年前引入 Titanium chemistry技術后,讀長增至約400 bp。最后還引入GS  Juinor,單次運行需要準備的樣品數目也減少了。
        每個454的HLA分析研究都包括一個用于PCR擴增的引物,可同時擴增多達10個HLA基因的1-3個外顯子,以及糾錯軟件和優化測序數據的第三方軟件。試劑盒提供4塊含干粉引物的PCR微量滴定板,每個可用于10個樣品測定。10個樣品進行中等分辨率分析需要一個板,而高分辨率分析則要求兩塊板。
        無論GS FLX或GS junior, PCR擴增子都是可直接對接454測序樣品準備的工作流程中。對于中等分辨率,GS FLX 每次可進行80個樣品的分析,GS junior每次可進行10個樣品的分析。對于高分辨率, FLX 每次可分析40個樣品的, Junior每次可分析5個樣品。
         除了HLA檢驗,454還有一些其他的靶位測序分析的發展空間,Mcleod表示454將會在人類健康護理方面有很大作用,包括許多特殊疾病。每一種都將由一套優化的引物和軟件組成。454計劃這些疾病相關的檢測將定期發布,約每3到6個月推出一次,其中許多檢測將來在臨床環境下非常有潛力。
 
更多454 HLA 產品 信息請點擊:
http://454.com/products-solutions/assays/gs-gtype-hla.asp
 


用戶名: 密碼: 匿名 快速注冊 忘記密碼
評論只代表網友觀點,不代表本站觀點。 請輸入驗證碼: 8795
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網 電話:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com
主站蜘蛛池模板: 穆棱市| 海原县| 新昌县| 荥经县| 罗定市| 濮阳市| 满洲里市| 安徽省| 亳州市| 准格尔旗| 阜平县| 勐海县| 屯昌县| 遂昌县| 巩留县| 华蓥市| 连城县| 阿荣旗| 什邡市| 仪征市| 丘北县| 蒙城县| 太白县| 武平县| 岐山县| 荥阳市| 陇西县| 安远县| 措勤县| 阜新市| 冷水江市| 贡山| 洞口县| 新源县| 图们市| 洱源县| 垣曲县| 武宁县| 宁南县| 二手房| 南通市|