2011 年 1 月,北京——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日推出 安捷倫 SureSelect XT 小鼠全外顯子試劑盒 ,這是全球首款可用于模式生物外顯子靶向序列捕獲的商業化系統,用以簡化下一代測序實驗。
日本 RIKEN 研究所使用安捷倫的 SureSelect 人全外顯子試劑盒,取得了優異成果。在此基礎上,安捷倫與該所的 Yoichi Gondo 博士聯手開發了小鼠外顯子靶向序列捕獲產品。
Gondo 博士說:“我們非常高興有機會與安捷倫共同開發這一創造性的新產品。我們使用自己的 ENU-誘變的小鼠基因組樣品對這一新產品進行了測試,該基因組中大約每 1Mb 就有一個位點出現 ENU 誘導的突變。使用 SureSelect 小鼠全外顯子試劑盒,在第一次試驗中就找到了 61 個 ENU 誘導的突變,這遠遠超出了我們的預期。”
安捷倫 SureSelect 平臺業務經理 Fred P. Ernani 博士說道:“人類外顯子靶向測序方法已被公認為是遺傳學中一種非常強大的研發工具,而安捷倫推出的用戶自定義 SureSelect 試劑盒和人外顯子 SureSelect 試劑盒系列產品憑借目前在業界遙遙領先的文獻引用記錄,當仁不讓地走在了這一輪發現大潮的最前方。小鼠作為一種模式生物,在人類疾病研究中一直扮演著重要的角色,因此小鼠外顯子靶向序列捕獲試劑盒的研發便順理成章地成為我們積極的 SureSelect 產品戰略的下一步重要舉措。”
SureSelect XT 在成熟可靠的 SureSelect 靶向序列捕獲系統的基礎上,整合了測序文庫制備以及基因組 DNA 制備試劑。將該系統與 安捷倫自動化系列產品 搭配使用,用戶即可暢享高性能靶向富集方案所帶來的超高效率的和前所未有的便捷操作。
隨著 SureSelect XT 小鼠全外顯子試劑盒的推出,安捷倫 SureSelect 試劑盒的種類增至 34 種(首款SureSelect試劑盒于 2009 年 2 月推出)。目前已有超過 25 篇文獻引用了該系統,涉及多種遺傳性疾病研究。
安捷倫 SureSelect XT 靶向序列捕獲系統提供目前市場上最全面的靶向富集完整解決方案以及針對多種不同測序方法和平臺的最優化分析流程。SureSelect XT 產品可用于在單管中富集從 200 Kb 到 50 Mb 的目標序列。
靶向序列捕獲使研究人員可以僅對目標基因組區域(而非整個基因組)進行測序,從而簡化工作流程。結合先進的下一代測序系統不斷提升的性能,SureSelect XT 平臺的多樣本檢測能力使基因學家可以在一次實驗中相比以前探索更多樣品的基因組。在過去,文庫制備和靶向富集一直是限制此類實驗速度的瓶頸之一。為了實現高通量的樣品處理,安捷倫提供了綜合式工作站,用于SureSelect XT 文庫制備和靶向富集工作流程的自動化。
本方案除了可以支持 Illumina單末端測序、雙末端測序和索引方案外,還支持 SOLiD 系統的片段文庫格式、雙末端測序和條形碼方案。最近,SureSelect 平臺還進一步擴展到 Roche 454 系統,從而可以為所有三大下一代測序主流平臺的用戶提供SureSelect 全線產品(包括用戶自定義產品和目錄產品)。
SureSelect XT 還為客戶提供高度靈活的定制化產品。用戶使用安捷倫 eArray xD 桌面設計工具,可以輕松設計出在單管中捕獲任何目標基因組的定制產品,從而有效提高研究效率。安捷倫還提供 eArray 在線設計工具,用戶使用該工具可定制與安捷倫目錄 SureSelect 試劑盒類似的產品,例如 SureSelect 小鼠全外顯子系列產品。