羅氏454和Integrated DNA技術公司就引物設計和供應達成全球獨家協議
瀏覽次數:5119 發(fā)布日期:2008-12-30
來源:本站 本站原創(chuàng),轉載請注明出處
454 生命科學( 羅氏子公司) 和美國集成DNA 技術公司( Integrated DNATechnologies, Inc.)今天宣布,他們已經達成了一項獨家的共同促銷協議,其中IDT負責設計、合成并純化454測序應用中必需的融合引物。這些應用包括用于檢測疾病相關基因的低頻率突變的超深度擴增子測序,和群體中常見的和稀有變異體的綜合鑒定和定量。這次的合作為Genome Sequencer FLX的用戶提供了引物合成的便利方案,簡化了工作流程,減輕了用戶在生物信息學方面的負擔。
IDT簡明易用的在線融合引物設計工具可利用提供的對照序列來構建針對目標DNA區(qū)域的相應的454融合引物。這些DNA區(qū)域可包括單個外顯子或一個甚至多個基因的所有外顯子。DNA二級結構,如發(fā)夾結構,可能會影響引物的性能。這個軟件考慮了整個融合引物的性能,而不是簡單地在其他標準PCR引物上加個454的通用接頭。除了454FusionPrimer設計,IDT在高保真合成和HPLC純化上也很有經驗,有助于研究人員獲得
454測序的最高品質數據。
“我們很高興利用了IDT在引物設計和合成上的豐富經驗,來為我們的客戶提供了目標重測序計劃的一站式解決方案。”454生命科學的CEO Chris McLeod表示,“把引物設計的任務交給IDT的在線工具來完成,研究人員現在能集中更多精力來實現探索。”
作為唯一能實現序列讀長超過400 bp的新一代測序技術,Genome Sequencer FLX系統可實現包括全部外顯子和其他基因組區(qū)域的單體型分析在內的綜合分析。該系統高度精確、超長序列讀長促使一系列強大應用成為可能,新的引物設計工具進一步簡化了這些工作。其中包括檢測癌癥樣品中低頻率體細胞突變的超深度測序,HIV感染個體的稀有變異探索,疾病相關區(qū)域外顯子序列分析,通過全基因組聯合分析和對16S核糖體RNA區(qū)域的鑒定來描繪出宏基因組樣品中的微生物豐度和多樣性。
454 生命科學是羅氏應用科學旗下卓越的中心之一,開發(fā)并商業(yè)化了創(chuàng)新的454 測序系統,用于超高通量的DNA 測序。具體的應用包括基因組的從頭測序和重測序、宏基因組學、RNA 分析和DNA 目標區(qū)域的定向測序。454 測序系統的特點是樣品制備簡單且無偏向性,讀長包括配對末端讀長超長且準確度高。454 測序系統的技術已經催生了各個研究領域的幾百項經同行評議的研究,例如癌癥和傳染病研究、藥物篩選、海洋生物學、人類學、古生物學等多個方面。更多信息,請查看http:///。