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179 次 使用MANTIS，通過Smart-seq3生成高質(zhì)量的單細胞RNA-seq數(shù)據(jù) 2025-6-20
單細胞RNA測序（scRNA-seq）是一項突破性技術(shù)，極大地提高了研究生物系統(tǒng)的分辨率。現(xiàn)在可以將復(fù)雜的組織分解成它們各自的細胞類型，并了解它們的基因表達模式。此外，現(xiàn)在不僅可以表征細胞群之
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201 次 使用桌面微流體技術(shù)實現(xiàn)低輸入RNA-Seq樣品制備的自動化和小型化 2025-6-18
引言：低輸入RNA-Seq工作流程的試劑和反應(yīng)體積的小型化和縮小，使研究人員能夠在低樣本輸入和增加樣本數(shù) 量的情況下工作。隨著反應(yīng)體積的減少，試劑體積的準(zhǔn)確傳遞成為保持?jǐn)?shù)據(jù)質(zhì)量和技術(shù)重復(fù)性
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655 次 WGBS揭示AtSAMS通過DNA甲基化植物花器官發(fā)育的表觀遺傳機制 2025-3-27
花器官是植物繁殖的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)，其發(fā)育受到嚴(yán)格的遺傳調(diào)控。ABC模型是解釋花器官發(fā)育的經(jīng)典理論，其中A、B、C、E功能基因分別調(diào)控萼片、花瓣、雄蕊和雌蕊的形成。然而，這些基因的表達調(diào)控機制尚未
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698 次 Cell文獻：轉(zhuǎn)座子外顯化構(gòu)成了一個受進化選擇的功能蛋白質(zhì)亞型儲庫 2025-3-24
轉(zhuǎn)座子（Transposable Elements，TEs），又稱轉(zhuǎn)座元件，指在基因組中能夠移動或復(fù)制，并可以整合到基因組新位點的一段DNA序列。可變剪接（Alternative Splicing，AS），又稱選擇性剪接，是指從一
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507 次 cfWGBS揭示與年齡和肌萎縮側(cè)索硬化相關(guān)cfDNA甲基化變化及組織 2025-2-27
游離細胞DNA (Cell-free DNA，cfDNA)是血漿中游離的DNA片段，通常來源于正常細胞更新或病理狀態(tài)下的細胞死亡。cfDNA已被廣泛應(yīng)用于癌癥早期檢測、胎兒遺傳病診斷、器官移植評估等領(lǐng)域。然而，cf
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663 次 時空組學(xué)研究進展（二)：單細胞RNA測序數(shù)據(jù)的分析方法 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0scRNA-seq 的原始數(shù)據(jù)格式和目前大多數(shù)scRNA-seq 分析過程都基于 FASTQ 文件（或壓縮格式 fq.gz）。Illumina 平臺測序數(shù)據(jù)默認生成 BCL 格式文件
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1094 次 時空組學(xué)研究進展（一）：單細胞RNA測序的流程與技術(shù) 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0單細胞測序概述單細胞測序（Single-cell RNA sequencing; scRNA-seq）是一種開創(chuàng)性的單細胞測序技術(shù)，現(xiàn)在已得到廣泛普及，并涵蓋了多種方法。盡
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1081 次 DAP-seq助力揭示番茄抗酸鋁分子調(diào)控新機制 2024-10-23
2024年10月2日，云南農(nóng)業(yè)大學(xué)園林園藝學(xué)院營養(yǎng)逆境與品質(zhì)改良楊建立/范偉團隊在Horticulture Research期刊(IF=7.6)上在線發(fā)表題為“SlSTOP1-regulated SlHAK5 expression confers Al toler
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978 次 Sfrp1抑制肺成纖維細胞向損傷誘導(dǎo)的肌成纖維細胞轉(zhuǎn)變期間的侵襲 2024-10-15
期刊：European Respiratory Journal影響因子：16.6主要技術(shù)：scRNA-seq；空間轉(zhuǎn)錄組；成纖維細胞導(dǎo)語組織纖維化是大多數(shù)主要慢性疾病中最大的未解決的臨床問題之一，產(chǎn)生細胞外基質(zhì)（ECM）的肌
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959 次 植物組學(xué)時代的DNA甲基化研究在群體表觀遺傳學(xué)中的應(yīng)用 2024-8-20
DNA甲基化在許多生物過程中發(fā)揮著重要作用。得益于數(shù)十年來對DNA甲基化突變體的研究，如今對DNA甲基化的建立和維持機制有了很好的理解，尤其在擬南芥（Arabidopsis thaliana）的Col-0品系中的研
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1081 次 空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)在揭示獨特和保守的腫瘤核心和邊緣結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用 2024-6-12
期刊：Nature Communications影響因子：16.6主要技術(shù)：ScRNA-seq、ST導(dǎo)語腫瘤微環(huán)境的空間組織對生物學(xué)和治療反應(yīng)有著深遠的影響。對hpv陰性口腔鱗狀細胞癌(OSCC)進行了單細胞和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
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994 次 DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析助力揭示AvERF73參與調(diào)控獼猴桃的耐澇性 2024-4-24
澇害（Waterlogging）是長期陰雨或暴雨后，由于地表積水，地面徑流不能及時排除，積水深度過大，時間過長，造成作物根部氧氣不足，并產(chǎn)生乙醇等有毒有害物質(zhì)，從而影響作物生長，甚至造成作物死
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847 次 RNA-seq技術(shù)探究從牛膝中分離得到的果膠多糖被人體腸道擬桿菌代謝 2023-9-25
期刊：Int J Biol Macromol影響因子：8.2伯豪技術(shù)服務(wù)：RNA-seq導(dǎo)語牛膝是治療骨質(zhì)疏松癥的著名中藥。多糖是形成腸道微生物群的主要因素，是雙棱草的主要成分。然而，雙歧桿菌多糖對人體腸道菌群
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953 次 scRNA-seq在彌漫性大B細胞淋巴瘤的單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜繪制中的應(yīng)用 2023-8-2
期刊：Cell Reports影響因子：8.8導(dǎo)語彌漫性大B細胞淋巴瘤（DLBCL）是最常見但侵襲性最強的B細胞淋巴瘤之一，大約40%的患者仍然無法治愈。本研究使用單細胞測序（scRNA-seq）技術(shù)成功繪制了彌漫
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1081 次 RNA-seq等技術(shù)應(yīng)用與探究結(jié)直腸癌遠端轉(zhuǎn)移起源于殘留的EMP1+細胞 2023-6-16
期刊：Nature影響因子：69.504導(dǎo)語大約30-40%的接受了原發(fā)性腫瘤根治性切除術(shù)的結(jié)直腸癌（colorectal cancer CRC）患者將在幾年后發(fā)生轉(zhuǎn)移。重要臟器的轉(zhuǎn)移及術(shù)后復(fù)發(fā)仍是主要的致死原因。然而，
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869 次 全基因組DNA甲基化和小RNA分析揭示甘藍型油菜種子的基因組不對稱性 2023-6-9
多倍體是被子植物基因組進化中的一種持續(xù)現(xiàn)象，有助于現(xiàn)存開花植物的多樣性。甘藍型油菜（Brassica napus）是世界上最重要的被子植物油料作物品種之一，起源于Brassica rapa（An）和Brassica ol
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742 次 小檗堿通過介導(dǎo)m6A mRNA甲基化調(diào)控斑馬魚肝細胞氧化應(yīng)激 2023-6-6
中藥小檗堿（Berberine，BBR，化學(xué)式C20H18NO4）是從幾種藥用植物中分離出的一種異喹啉季生物堿，包括小檗（Berberis aristata）和黃連（Coptis chinensis）。小檗堿可改善脂質(zhì)代謝紊亂誘導(dǎo)的細
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1130 次 全基因組ChIP-seq分析揭示細菌轉(zhuǎn)錄因子PhoB的基因內(nèi)結(jié)合位點 2023-5-30
細菌編碼許多轉(zhuǎn)錄因子（transcription factor，TF），這些轉(zhuǎn)錄因子通過與啟動子周圍的DNA結(jié)合并調(diào)控RNA聚合酶（RNAP）全酶以結(jié)合啟動子DNA或異構(gòu)化為主動轉(zhuǎn)錄構(gòu)象的能力來調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄起始。目前對T
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885 次 MeRIP-seq等揭示m6A reader YTHDF1在結(jié)直腸癌PD-1免疫治療中的作用 2023-5-26
大家好，這里是專注表觀組學(xué)十余年，領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)的易基因。結(jié)直腸癌（colorectal cancer ，CRC）是全球最常見的癌癥之一，轉(zhuǎn)移性CRC患者的5年生存率低于20%。免疫檢查點阻斷（Immune che
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1004 次 mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序應(yīng)用于原位自組裝類器官用于軟骨組織再生 2023-5-24
期刊：Bioact Mater影響因子：14.593導(dǎo)語由于在誘導(dǎo)間充質(zhì)干細胞(MSCs)向軟骨和骨室的空間、定向和可控分化方面存在困難，分級骨軟骨單位的再生具有挑戰(zhàn)性。新興的類器官技術(shù)為骨軟骨再生提供了
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